Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mbd3Q9Z2D8 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mbd3Q9Z2D8 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mbd3Q9Z2D8 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mbd3Q9Z2D8 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mbd3Q9Z2D8 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mbd3Q9Z2D8 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mbd3Q9Z2D8 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mbd3Q9Z2D8 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mbd3Q9Z2D8 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mbd3Q9Z2D8 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mbd3Q9Z2D8 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mbd3Q9Z2D8 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mbd3Q9Z2D8 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mbd3Q9Z2D8 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mbd3Q9Z2D8 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mbd3Q9Z2D8 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mbd3Q9Z2D8 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mbd3Q9Z2D8 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Mbd3Q9Z2D8 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mbd3Q9Z2D8 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mbd3Q9Z2D8 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mbd3Q9Z2D8 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mbd3Q9Z2D8 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mbd3Q9Z2D8 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mbd3Q9Z2D8 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mbd3Q9Z2D8 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mbd3Q9Z2D8 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mbd3Q9Z2D8 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mbd3Q9Z2D8 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mbd3Q9Z2D8 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Mbd3Q9Z2D8 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Mbd3Q9Z2D8 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Mbd3Q9Z2D8 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Mbd3Q9Z2D8 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Mbd3Q9Z2D8 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Mbd3Q9Z2D8 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Mbd3Q9Z2D8 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Mbd3Q9Z2D8 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Mbd3Q9Z2D8 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Mbd3Q9Z2D8 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Mbd3Q9Z2D8 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Mbd3Q9Z2D8 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Mbd3Q9Z2D8 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Mbd3Q9Z2D8 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Mbd3Q9Z2D8 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Mbd3Q9Z2D8 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Mbd3Q9Z2D8 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Mbd3Q9Z2D8 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Mbd3Q9Z2D8 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Mbd3Q9Z2D8 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Mbd3Q9Z2D8 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Mbd3Q9Z2D8 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Mbd3Q9Z2D8 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Mbd3Q9Z2D8 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Mbd3Q9Z2D8 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Mbd3Q9Z2D8 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Mbd3Q9Z2D8 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Mbd3Q9Z2D8 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Mbd3Q9Z2D8 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Mbd3Q9Z2D8 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Mbd3Q9Z2D8 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Mbd3Q9Z2D8 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Mbd3Q9Z2D8 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Mbd3Q9Z2D8 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Mbd3Q9Z2D8 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Mbd3Q9Z2D8 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Mbd3Q9Z2D8 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Mbd3Q9Z2D8 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Mbd3Q9Z2D8 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Mbd3Q9Z2D8 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Mbd3Q9Z2D8 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Mbd3Q9Z2D8 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Mbd3Q9Z2D8 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Mbd3Q9Z2D8 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Mbd3Q9Z2D8 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Mbd3Q9Z2D8 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Mbd3Q9Z2D8 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Mbd3Q9Z2D8 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Mbd3Q9Z2D8 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Mbd3Q9Z2D8 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Mbd3Q9Z2D8 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Mbd3Q9Z2D8 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Mbd3Q9Z2D8 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Mbd3Q9Z2D8 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Mbd3Q9Z2D8 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Mbd3Q9Z2D8 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Mbd3Q9Z2D8 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Mbd3Q9Z2D8 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Mbd3Q9Z2D8 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Mbd3Q9Z2D8 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Mbd3Q9Z2D8 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Mbd3Q9Z2D8 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Mbd3Q9Z2D8 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Mbd3Q9Z2D8 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Mbd3Q9Z2D8 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Mbd3Q9Z2D8 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Mbd3Q9Z2D8 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Mbd3Q9Z2D8 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Mbd3Q9Z2D8 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms