Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2A0

Pdpk1, 3-phosphoinositide-dependent protein kinase 1, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdpk1Q9Z2A0 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pdpk1Q9Z2A0 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pdpk1Q9Z2A0 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pdpk1Q9Z2A0 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdpk1Q9Z2A0 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdpk1Q9Z2A0 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdpk1Q9Z2A0 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdpk1Q9Z2A0 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdpk1Q9Z2A0 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdpk1Q9Z2A0 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdpk1Q9Z2A0 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdpk1Q9Z2A0 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdpk1Q9Z2A0 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdpk1Q9Z2A0 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdpk1Q9Z2A0 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdpk1Q9Z2A0 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdpk1Q9Z2A0 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdpk1Q9Z2A0 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdpk1Q9Z2A0 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdpk1Q9Z2A0 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdpk1Q9Z2A0 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdpk1Q9Z2A0 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdpk1Q9Z2A0 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdpk1Q9Z2A0 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdpk1Q9Z2A0 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdpk1Q9Z2A0 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdpk1Q9Z2A0 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdpk1Q9Z2A0 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdpk1Q9Z2A0 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdpk1Q9Z2A0 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdpk1Q9Z2A0 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdpk1Q9Z2A0 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdpk1Q9Z2A0 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdpk1Q9Z2A0 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdpk1Q9Z2A0 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdpk1Q9Z2A0 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdpk1Q9Z2A0 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdpk1Q9Z2A0 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdpk1Q9Z2A0 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdpk1Q9Z2A0 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdpk1Q9Z2A0 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdpk1Q9Z2A0 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdpk1Q9Z2A0 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdpk1Q9Z2A0 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdpk1Q9Z2A0 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdpk1Q9Z2A0 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdpk1Q9Z2A0 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdpk1Q9Z2A0 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdpk1Q9Z2A0 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdpk1Q9Z2A0 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdpk1Q9Z2A0 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdpk1Q9Z2A0 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdpk1Q9Z2A0 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdpk1Q9Z2A0 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdpk1Q9Z2A0 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Pdpk1Q9Z2A0 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdpk1Q9Z2A0 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdpk1Q9Z2A0 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdpk1Q9Z2A0 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdpk1Q9Z2A0 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdpk1Q9Z2A0 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdpk1Q9Z2A0 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdpk1Q9Z2A0 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdpk1Q9Z2A0 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Pdpk1Q9Z2A0 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdpk1Q9Z2A0 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdpk1Q9Z2A0 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdpk1Q9Z2A0 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdpk1Q9Z2A0 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdpk1Q9Z2A0 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdpk1Q9Z2A0 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdpk1Q9Z2A0 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdpk1Q9Z2A0 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdpk1Q9Z2A0 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
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Pdpk1Q9Z2A0 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdpk1Q9Z2A0 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdpk1Q9Z2A0 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdpk1Q9Z2A0 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdpk1Q9Z2A0 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdpk1Q9Z2A0 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdpk1Q9Z2A0 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdpk1Q9Z2A0 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdpk1Q9Z2A0 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdpk1Q9Z2A0 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdpk1Q9Z2A0 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdpk1Q9Z2A0 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdpk1Q9Z2A0 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdpk1Q9Z2A0 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdpk1Q9Z2A0 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdpk1Q9Z2A0 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdpk1Q9Z2A0 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdpk1Q9Z2A0 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdpk1Q9Z2A0 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdpk1Q9Z2A0 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdpk1Q9Z2A0 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdpk1Q9Z2A0 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdpk1Q9Z2A0 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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