Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn8Q9Z260 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn8Q9Z260 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn8Q9Z260 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn8Q9Z260 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn8Q9Z260 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn8Q9Z260 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn8Q9Z260 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn8Q9Z260 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn8Q9Z260 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn8Q9Z260 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn8Q9Z260 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn8Q9Z260 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn8Q9Z260 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn8Q9Z260 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn8Q9Z260 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn8Q9Z260 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn8Q9Z260 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn8Q9Z260 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn8Q9Z260 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn8Q9Z260 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn8Q9Z260 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn8Q9Z260 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn8Q9Z260 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn8Q9Z260 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn8Q9Z260 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn8Q9Z260 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn8Q9Z260 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn8Q9Z260 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn8Q9Z260 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn8Q9Z260 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn8Q9Z260 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn8Q9Z260 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn8Q9Z260 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn8Q9Z260 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn8Q9Z260 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn8Q9Z260 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn8Q9Z260 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn8Q9Z260 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn8Q9Z260 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn8Q9Z260 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn8Q9Z260 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn8Q9Z260 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn8Q9Z260 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn8Q9Z260 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn8Q9Z260 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn8Q9Z260 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn8Q9Z260 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn8Q9Z260 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn8Q9Z260 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn8Q9Z260 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn8Q9Z260 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn8Q9Z260 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn8Q9Z260 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn8Q9Z260 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn8Q9Z260 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn8Q9Z260 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn8Q9Z260 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn8Q9Z260 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn8Q9Z260 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn8Q9Z260 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn8Q9Z260 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn8Q9Z260 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn8Q9Z260 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn8Q9Z260 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn8Q9Z260 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn8Q9Z260 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn8Q9Z260 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn8Q9Z260 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn8Q9Z260 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn8Q9Z260 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn8Q9Z260 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn8Q9Z260 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn8Q9Z260 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn8Q9Z260 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn8Q9Z260 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn8Q9Z260 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn8Q9Z260 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms