Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N5

Ddx39b, Spliceosome RNA helicase Ddx39b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx39bQ9Z1N5 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ddx39bQ9Z1N5 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ddx39bQ9Z1N5 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ddx39bQ9Z1N5 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ddx39bQ9Z1N5 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ddx39bQ9Z1N5 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ddx39bQ9Z1N5 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ddx39bQ9Z1N5 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ddx39bQ9Z1N5 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ddx39bQ9Z1N5 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ddx39bQ9Z1N5 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ddx39bQ9Z1N5 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ddx39bQ9Z1N5 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ddx39bQ9Z1N5 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ddx39bQ9Z1N5 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ddx39bQ9Z1N5 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ddx39bQ9Z1N5 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ddx39bQ9Z1N5 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ddx39bQ9Z1N5 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ddx39bQ9Z1N5 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ddx39bQ9Z1N5 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ddx39bQ9Z1N5 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ddx39bQ9Z1N5 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ddx39bQ9Z1N5 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ddx39bQ9Z1N5 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ddx39bQ9Z1N5 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ddx39bQ9Z1N5 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ddx39bQ9Z1N5 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddx39bQ9Z1N5 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddx39bQ9Z1N5 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddx39bQ9Z1N5 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddx39bQ9Z1N5 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddx39bQ9Z1N5 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddx39bQ9Z1N5 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddx39bQ9Z1N5 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddx39bQ9Z1N5 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddx39bQ9Z1N5 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddx39bQ9Z1N5 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddx39bQ9Z1N5 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddx39bQ9Z1N5 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddx39bQ9Z1N5 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddx39bQ9Z1N5 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddx39bQ9Z1N5 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddx39bQ9Z1N5 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddx39bQ9Z1N5 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddx39bQ9Z1N5 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ddx39bQ9Z1N5 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ddx39bQ9Z1N5 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ddx39bQ9Z1N5 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ddx39bQ9Z1N5 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ddx39bQ9Z1N5 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ddx39bQ9Z1N5 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ddx39bQ9Z1N5 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ddx39bQ9Z1N5 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ddx39bQ9Z1N5 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ddx39bQ9Z1N5 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ddx39bQ9Z1N5 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ddx39bQ9Z1N5 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ddx39bQ9Z1N5 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ddx39bQ9Z1N5 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ddx39bQ9Z1N5 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ddx39bQ9Z1N5 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Ddx39bQ9Z1N5 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ddx39bQ9Z1N5 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ddx39bQ9Z1N5 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ddx39bQ9Z1N5 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ddx39bQ9Z1N5 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ddx39bQ9Z1N5 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ddx39bQ9Z1N5 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ddx39bQ9Z1N5 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ddx39bQ9Z1N5 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ddx39bQ9Z1N5 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ddx39bQ9Z1N5 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ddx39bQ9Z1N5 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ddx39bQ9Z1N5 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ddx39bQ9Z1N5 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ddx39bQ9Z1N5 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ddx39bQ9Z1N5 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ddx39bQ9Z1N5 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ddx39bQ9Z1N5 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ddx39bQ9Z1N5 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ddx39bQ9Z1N5 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ddx39bQ9Z1N5 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ddx39bQ9Z1N5 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ddx39bQ9Z1N5 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ddx39bQ9Z1N5 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ddx39bQ9Z1N5 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ddx39bQ9Z1N5 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ddx39bQ9Z1N5 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ddx39bQ9Z1N5 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ddx39bQ9Z1N5 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ddx39bQ9Z1N5 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ddx39bQ9Z1N5 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ddx39bQ9Z1N5 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ddx39bQ9Z1N5 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ddx39bQ9Z1N5 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ddx39bQ9Z1N5 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ddx39bQ9Z1N5 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ddx39bQ9Z1N5 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ddx39bQ9Z1N5 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms