Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1E3

Nfkbia, NF-kappa-B inhibitor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfkbiaQ9Z1E3 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NfkbiaQ9Z1E3 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NfkbiaQ9Z1E3 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NfkbiaQ9Z1E3 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NfkbiaQ9Z1E3 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NfkbiaQ9Z1E3 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NfkbiaQ9Z1E3 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NfkbiaQ9Z1E3 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NfkbiaQ9Z1E3 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NfkbiaQ9Z1E3 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NfkbiaQ9Z1E3 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NfkbiaQ9Z1E3 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NfkbiaQ9Z1E3 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NfkbiaQ9Z1E3 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NfkbiaQ9Z1E3 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NfkbiaQ9Z1E3 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NfkbiaQ9Z1E3 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NfkbiaQ9Z1E3 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NfkbiaQ9Z1E3 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NfkbiaQ9Z1E3 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NfkbiaQ9Z1E3 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NfkbiaQ9Z1E3 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NfkbiaQ9Z1E3 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NfkbiaQ9Z1E3 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NfkbiaQ9Z1E3 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NfkbiaQ9Z1E3 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NfkbiaQ9Z1E3 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NfkbiaQ9Z1E3 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NfkbiaQ9Z1E3 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NfkbiaQ9Z1E3 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NfkbiaQ9Z1E3 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NfkbiaQ9Z1E3 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NfkbiaQ9Z1E3 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NfkbiaQ9Z1E3 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NfkbiaQ9Z1E3 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NfkbiaQ9Z1E3 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NfkbiaQ9Z1E3 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NfkbiaQ9Z1E3 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NfkbiaQ9Z1E3 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NfkbiaQ9Z1E3 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NfkbiaQ9Z1E3 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NfkbiaQ9Z1E3 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NfkbiaQ9Z1E3 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NfkbiaQ9Z1E3 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NfkbiaQ9Z1E3 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NfkbiaQ9Z1E3 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NfkbiaQ9Z1E3 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NfkbiaQ9Z1E3 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NfkbiaQ9Z1E3 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NfkbiaQ9Z1E3 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NfkbiaQ9Z1E3 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NfkbiaQ9Z1E3 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NfkbiaQ9Z1E3 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NfkbiaQ9Z1E3 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NfkbiaQ9Z1E3 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NfkbiaQ9Z1E3 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NfkbiaQ9Z1E3 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NfkbiaQ9Z1E3 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NfkbiaQ9Z1E3 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NfkbiaQ9Z1E3 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NfkbiaQ9Z1E3 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NfkbiaQ9Z1E3 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NfkbiaQ9Z1E3 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NfkbiaQ9Z1E3 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NfkbiaQ9Z1E3 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NfkbiaQ9Z1E3 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NfkbiaQ9Z1E3 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NfkbiaQ9Z1E3 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NfkbiaQ9Z1E3 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NfkbiaQ9Z1E3 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NfkbiaQ9Z1E3 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NfkbiaQ9Z1E3 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NfkbiaQ9Z1E3 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NfkbiaQ9Z1E3 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NfkbiaQ9Z1E3 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NfkbiaQ9Z1E3 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NfkbiaQ9Z1E3 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NfkbiaQ9Z1E3 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NfkbiaQ9Z1E3 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NfkbiaQ9Z1E3 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NfkbiaQ9Z1E3 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NfkbiaQ9Z1E3 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
NfkbiaQ9Z1E3 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NfkbiaQ9Z1E3 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NfkbiaQ9Z1E3 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NfkbiaQ9Z1E3 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
NfkbiaQ9Z1E3 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NfkbiaQ9Z1E3 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NfkbiaQ9Z1E3 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NfkbiaQ9Z1E3 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NfkbiaQ9Z1E3 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
NfkbiaQ9Z1E3 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NfkbiaQ9Z1E3 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NfkbiaQ9Z1E3 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NfkbiaQ9Z1E3 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NfkbiaQ9Z1E3 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NfkbiaQ9Z1E3 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NfkbiaQ9Z1E3 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NfkbiaQ9Z1E3 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NfkbiaQ9Z1E3 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms