Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z140

Cpne6, Copine-6, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne6Q9Z140 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms