Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0E6

Gbp2, Guanylate-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp2Q9Z0E6 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gbp2Q9Z0E6 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gbp2Q9Z0E6 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gbp2Q9Z0E6 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gbp2Q9Z0E6 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gbp2Q9Z0E6 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gbp2Q9Z0E6 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gbp2Q9Z0E6 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gbp2Q9Z0E6 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gbp2Q9Z0E6 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gbp2Q9Z0E6 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gbp2Q9Z0E6 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gbp2Q9Z0E6 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gbp2Q9Z0E6 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gbp2Q9Z0E6 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gbp2Q9Z0E6 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gbp2Q9Z0E6 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gbp2Q9Z0E6 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gbp2Q9Z0E6 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gbp2Q9Z0E6 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gbp2Q9Z0E6 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gbp2Q9Z0E6 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gbp2Q9Z0E6 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gbp2Q9Z0E6 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gbp2Q9Z0E6 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gbp2Q9Z0E6 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gbp2Q9Z0E6 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gbp2Q9Z0E6 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gbp2Q9Z0E6 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gbp2Q9Z0E6 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gbp2Q9Z0E6 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gbp2Q9Z0E6 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gbp2Q9Z0E6 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gbp2Q9Z0E6 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gbp2Q9Z0E6 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gbp2Q9Z0E6 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gbp2Q9Z0E6 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gbp2Q9Z0E6 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gbp2Q9Z0E6 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gbp2Q9Z0E6 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gbp2Q9Z0E6 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gbp2Q9Z0E6 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gbp2Q9Z0E6 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gbp2Q9Z0E6 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gbp2Q9Z0E6 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gbp2Q9Z0E6 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gbp2Q9Z0E6 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gbp2Q9Z0E6 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gbp2Q9Z0E6 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gbp2Q9Z0E6 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gbp2Q9Z0E6 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gbp2Q9Z0E6 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gbp2Q9Z0E6 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbp2Q9Z0E6 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbp2Q9Z0E6 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbp2Q9Z0E6 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbp2Q9Z0E6 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbp2Q9Z0E6 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbp2Q9Z0E6 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbp2Q9Z0E6 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbp2Q9Z0E6 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbp2Q9Z0E6 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbp2Q9Z0E6 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbp2Q9Z0E6 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbp2Q9Z0E6 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbp2Q9Z0E6 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbp2Q9Z0E6 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbp2Q9Z0E6 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbp2Q9Z0E6 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbp2Q9Z0E6 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbp2Q9Z0E6 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbp2Q9Z0E6 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbp2Q9Z0E6 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbp2Q9Z0E6 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbp2Q9Z0E6 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbp2Q9Z0E6 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbp2Q9Z0E6 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbp2Q9Z0E6 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbp2Q9Z0E6 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbp2Q9Z0E6 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbp2Q9Z0E6 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbp2Q9Z0E6 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbp2Q9Z0E6 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbp2Q9Z0E6 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbp2Q9Z0E6 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbp2Q9Z0E6 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbp2Q9Z0E6 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbp2Q9Z0E6 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbp2Q9Z0E6 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbp2Q9Z0E6 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbp2Q9Z0E6 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbp2Q9Z0E6 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbp2Q9Z0E6 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbp2Q9Z0E6 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbp2Q9Z0E6 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbp2Q9Z0E6 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbp2Q9Z0E6 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbp2Q9Z0E6 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbp2Q9Z0E6 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbp2Q9Z0E6 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.8 ms