Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU00

Nrf1, Nuclear respiratory factor 1, mousemouse

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Length 503 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrf1Q9WU00 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nrf1Q9WU00 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nrf1Q9WU00 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nrf1Q9WU00 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nrf1Q9WU00 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nrf1Q9WU00 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nrf1Q9WU00 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nrf1Q9WU00 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nrf1Q9WU00 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nrf1Q9WU00 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nrf1Q9WU00 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nrf1Q9WU00 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nrf1Q9WU00 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Nrf1Q9WU00 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nrf1Q9WU00 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Nrf1Q9WU00 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nrf1Q9WU00 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nrf1Q9WU00 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Nrf1Q9WU00 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nrf1Q9WU00 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nrf1Q9WU00 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nrf1Q9WU00 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nrf1Q9WU00 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nrf1Q9WU00 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nrf1Q9WU00 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nrf1Q9WU00 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nrf1Q9WU00 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nrf1Q9WU00 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nrf1Q9WU00 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nrf1Q9WU00 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nrf1Q9WU00 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nrf1Q9WU00 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nrf1Q9WU00 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nrf1Q9WU00 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nrf1Q9WU00 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Nrf1Q9WU00 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Nrf1Q9WU00 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nrf1Q9WU00 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Nrf1Q9WU00 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Nrf1Q9WU00 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Nrf1Q9WU00 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nrf1Q9WU00 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Nrf1Q9WU00 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nrf1Q9WU00 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nrf1Q9WU00 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nrf1Q9WU00 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nrf1Q9WU00 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nrf1Q9WU00 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Nrf1Q9WU00 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nrf1Q9WU00 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms