Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1T4

Sept6, Septin-6, mousemouse

Predictions only

Length 434 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sept6Q9R1T4 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sept6Q9R1T4 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sept6Q9R1T4 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sept6Q9R1T4 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sept6Q9R1T4 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sept6Q9R1T4 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Sept6Q9R1T4 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sept6Q9R1T4 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sept6Q9R1T4 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sept6Q9R1T4 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sept6Q9R1T4 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sept6Q9R1T4 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sept6Q9R1T4 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sept6Q9R1T4 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Sept6Q9R1T4 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sept6Q9R1T4 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sept6Q9R1T4 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Sept6Q9R1T4 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sept6Q9R1T4 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sept6Q9R1T4 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sept6Q9R1T4 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sept6Q9R1T4 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sept6Q9R1T4 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sept6Q9R1T4 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sept6Q9R1T4 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sept6Q9R1T4 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sept6Q9R1T4 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sept6Q9R1T4 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sept6Q9R1T4 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sept6Q9R1T4 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Sept6Q9R1T4 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sept6Q9R1T4 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sept6Q9R1T4 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sept6Q9R1T4 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sept6Q9R1T4 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sept6Q9R1T4 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sept6Q9R1T4 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sept6Q9R1T4 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Sept6Q9R1T4 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sept6Q9R1T4 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sept6Q9R1T4 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sept6Q9R1T4 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sept6Q9R1T4 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sept6Q9R1T4 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sept6Q9R1T4 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sept6Q9R1T4 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Sept6Q9R1T4 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sept6Q9R1T4 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sept6Q9R1T4 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sept6Q9R1T4 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sept6Q9R1T4 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sept6Q9R1T4 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sept6Q9R1T4 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sept6Q9R1T4 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sept6Q9R1T4 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sept6Q9R1T4 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Sept6Q9R1T4 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sept6Q9R1T4 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sept6Q9R1T4 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sept6Q9R1T4 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Sept6Q9R1T4 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sept6Q9R1T4 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sept6Q9R1T4 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sept6Q9R1T4 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sept6Q9R1T4 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sept6Q9R1T4 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sept6Q9R1T4 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sept6Q9R1T4 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sept6Q9R1T4 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sept6Q9R1T4 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sept6Q9R1T4 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sept6Q9R1T4 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sept6Q9R1T4 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sept6Q9R1T4 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sept6Q9R1T4 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sept6Q9R1T4 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sept6Q9R1T4 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sept6Q9R1T4 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sept6Q9R1T4 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sept6Q9R1T4 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sept6Q9R1T4 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sept6Q9R1T4 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sept6Q9R1T4 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sept6Q9R1T4 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sept6Q9R1T4 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Sept6Q9R1T4 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Sept6Q9R1T4 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sept6Q9R1T4 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sept6Q9R1T4 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sept6Q9R1T4 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sept6Q9R1T4 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sept6Q9R1T4 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sept6Q9R1T4 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sept6Q9R1T4 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sept6Q9R1T4 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sept6Q9R1T4 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sept6Q9R1T4 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sept6Q9R1T4 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sept6Q9R1T4 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Sept6Q9R1T4 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms