Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0G8

Nrk, Nik-related protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrkQ9R0G8 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NrkQ9R0G8 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NrkQ9R0G8 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NrkQ9R0G8 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NrkQ9R0G8 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NrkQ9R0G8 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NrkQ9R0G8 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NrkQ9R0G8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NrkQ9R0G8 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NrkQ9R0G8 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NrkQ9R0G8 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NrkQ9R0G8 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NrkQ9R0G8 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
NrkQ9R0G8 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
NrkQ9R0G8 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NrkQ9R0G8 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NrkQ9R0G8 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NrkQ9R0G8 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NrkQ9R0G8 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NrkQ9R0G8 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
NrkQ9R0G8 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NrkQ9R0G8 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NrkQ9R0G8 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NrkQ9R0G8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NrkQ9R0G8 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NrkQ9R0G8 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NrkQ9R0G8 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NrkQ9R0G8 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NrkQ9R0G8 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NrkQ9R0G8 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NrkQ9R0G8 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NrkQ9R0G8 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NrkQ9R0G8 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NrkQ9R0G8 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NrkQ9R0G8 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NrkQ9R0G8 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NrkQ9R0G8 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NrkQ9R0G8 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NrkQ9R0G8 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NrkQ9R0G8 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NrkQ9R0G8 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NrkQ9R0G8 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NrkQ9R0G8 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NrkQ9R0G8 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NrkQ9R0G8 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NrkQ9R0G8 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NrkQ9R0G8 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NrkQ9R0G8 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NrkQ9R0G8 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
NrkQ9R0G8 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NrkQ9R0G8 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NrkQ9R0G8 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NrkQ9R0G8 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NrkQ9R0G8 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NrkQ9R0G8 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NrkQ9R0G8 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NrkQ9R0G8 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NrkQ9R0G8 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NrkQ9R0G8 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NrkQ9R0G8 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NrkQ9R0G8 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NrkQ9R0G8 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NrkQ9R0G8 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NrkQ9R0G8 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NrkQ9R0G8 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
NrkQ9R0G8 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
NrkQ9R0G8 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NrkQ9R0G8 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NrkQ9R0G8 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NrkQ9R0G8 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NrkQ9R0G8 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NrkQ9R0G8 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NrkQ9R0G8 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NrkQ9R0G8 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NrkQ9R0G8 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NrkQ9R0G8 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NrkQ9R0G8 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NrkQ9R0G8 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NrkQ9R0G8 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
NrkQ9R0G8 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NrkQ9R0G8 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NrkQ9R0G8 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NrkQ9R0G8 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NrkQ9R0G8 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NrkQ9R0G8 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NrkQ9R0G8 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NrkQ9R0G8 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NrkQ9R0G8 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
NrkQ9R0G8 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
NrkQ9R0G8 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
NrkQ9R0G8 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
NrkQ9R0G8 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
NrkQ9R0G8 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
NrkQ9R0G8 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NrkQ9R0G8 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NrkQ9R0G8 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NrkQ9R0G8 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NrkQ9R0G8 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NrkQ9R0G8 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NrkQ9R0G8 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms