Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Col4a3Q9QZS0 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Col4a3Q9QZS0 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Col4a3Q9QZS0 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Col4a3Q9QZS0 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Col4a3Q9QZS0 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.83■□□□□ 0.29
Col4a3Q9QZS0 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Col4a3Q9QZS0 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Col4a3Q9QZS0 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Col4a3Q9QZS0 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Col4a3Q9QZS0 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Col4a3Q9QZS0 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Col4a3Q9QZS0 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Col4a3Q9QZS0 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Col4a3Q9QZS0 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Col4a3Q9QZS0 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Col4a3Q9QZS0 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Col4a3Q9QZS0 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Col4a3Q9QZS0 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Col4a3Q9QZS0 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Col4a3Q9QZS0 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Col4a3Q9QZS0 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Col4a3Q9QZS0 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Col4a3Q9QZS0 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Col4a3Q9QZS0 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Col4a3Q9QZS0 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Col4a3Q9QZS0 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Col4a3Q9QZS0 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Col4a3Q9QZS0 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Col4a3Q9QZS0 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Col4a3Q9QZS0 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Col4a3Q9QZS0 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Col4a3Q9QZS0 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Col4a3Q9QZS0 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Col4a3Q9QZS0 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Col4a3Q9QZS0 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Col4a3Q9QZS0 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Col4a3Q9QZS0 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Col4a3Q9QZS0 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Col4a3Q9QZS0 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Col4a3Q9QZS0 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Col4a3Q9QZS0 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Col4a3Q9QZS0 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Col4a3Q9QZS0 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Col4a3Q9QZS0 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Col4a3Q9QZS0 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Col4a3Q9QZS0 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Col4a3Q9QZS0 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Col4a3Q9QZS0 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Col4a3Q9QZS0 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Col4a3Q9QZS0 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Col4a3Q9QZS0 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Col4a3Q9QZS0 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Col4a3Q9QZS0 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Col4a3Q9QZS0 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Col4a3Q9QZS0 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Col4a3Q9QZS0 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Col4a3Q9QZS0 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Col4a3Q9QZS0 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Col4a3Q9QZS0 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Col4a3Q9QZS0 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Col4a3Q9QZS0 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Col4a3Q9QZS0 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Col4a3Q9QZS0 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Col4a3Q9QZS0 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Col4a3Q9QZS0 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Col4a3Q9QZS0 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Col4a3Q9QZS0 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Col4a3Q9QZS0 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Col4a3Q9QZS0 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Col4a3Q9QZS0 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Col4a3Q9QZS0 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Col4a3Q9QZS0 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Col4a3Q9QZS0 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Col4a3Q9QZS0 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Col4a3Q9QZS0 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Col4a3Q9QZS0 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Col4a3Q9QZS0 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Col4a3Q9QZS0 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Col4a3Q9QZS0 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Col4a3Q9QZS0 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Col4a3Q9QZS0 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Col4a3Q9QZS0 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Col4a3Q9QZS0 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Col4a3Q9QZS0 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Col4a3Q9QZS0 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Col4a3Q9QZS0 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Col4a3Q9QZS0 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Col4a3Q9QZS0 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Col4a3Q9QZS0 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Col4a3Q9QZS0 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Col4a3Q9QZS0 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Col4a3Q9QZS0 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Col4a3Q9QZS0 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Col4a3Q9QZS0 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Col4a3Q9QZS0 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Col4a3Q9QZS0 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Col4a3Q9QZS0 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Col4a3Q9QZS0 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Col4a3Q9QZS0 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
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