Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD5

Chml, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmlQ9QZD5 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ChmlQ9QZD5 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ChmlQ9QZD5 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ChmlQ9QZD5 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ChmlQ9QZD5 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ChmlQ9QZD5 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ChmlQ9QZD5 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms