Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ09

Phtf1, Putative homeodomain transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phtf1Q9QZ09 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Phtf1Q9QZ09 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Phtf1Q9QZ09 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Phtf1Q9QZ09 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Phtf1Q9QZ09 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Phtf1Q9QZ09 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Phtf1Q9QZ09 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Phtf1Q9QZ09 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Phtf1Q9QZ09 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Phtf1Q9QZ09 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Phtf1Q9QZ09 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Phtf1Q9QZ09 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Phtf1Q9QZ09 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Phtf1Q9QZ09 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Phtf1Q9QZ09 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Phtf1Q9QZ09 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Phtf1Q9QZ09 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Phtf1Q9QZ09 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Phtf1Q9QZ09 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Phtf1Q9QZ09 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Phtf1Q9QZ09 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Phtf1Q9QZ09 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Phtf1Q9QZ09 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Phtf1Q9QZ09 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Phtf1Q9QZ09 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Phtf1Q9QZ09 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Phtf1Q9QZ09 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Phtf1Q9QZ09 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Phtf1Q9QZ09 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Phtf1Q9QZ09 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Phtf1Q9QZ09 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Phtf1Q9QZ09 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Phtf1Q9QZ09 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Phtf1Q9QZ09 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Phtf1Q9QZ09 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Phtf1Q9QZ09 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Phtf1Q9QZ09 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Phtf1Q9QZ09 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Phtf1Q9QZ09 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Phtf1Q9QZ09 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Phtf1Q9QZ09 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Phtf1Q9QZ09 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Phtf1Q9QZ09 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Phtf1Q9QZ09 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Phtf1Q9QZ09 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Phtf1Q9QZ09 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Phtf1Q9QZ09 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Phtf1Q9QZ09 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Phtf1Q9QZ09 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Phtf1Q9QZ09 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Phtf1Q9QZ09 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Phtf1Q9QZ09 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Phtf1Q9QZ09 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Phtf1Q9QZ09 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Phtf1Q9QZ09 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Phtf1Q9QZ09 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Phtf1Q9QZ09 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Phtf1Q9QZ09 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Phtf1Q9QZ09 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Phtf1Q9QZ09 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Phtf1Q9QZ09 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Phtf1Q9QZ09 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Phtf1Q9QZ09 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Phtf1Q9QZ09 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Phtf1Q9QZ09 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Phtf1Q9QZ09 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Phtf1Q9QZ09 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Phtf1Q9QZ09 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Phtf1Q9QZ09 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Phtf1Q9QZ09 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Phtf1Q9QZ09 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Phtf1Q9QZ09 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Phtf1Q9QZ09 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Phtf1Q9QZ09 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Phtf1Q9QZ09 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Phtf1Q9QZ09 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Phtf1Q9QZ09 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Phtf1Q9QZ09 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Phtf1Q9QZ09 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Phtf1Q9QZ09 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Phtf1Q9QZ09 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Phtf1Q9QZ09 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Phtf1Q9QZ09 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Phtf1Q9QZ09 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Phtf1Q9QZ09 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Phtf1Q9QZ09 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Phtf1Q9QZ09 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Phtf1Q9QZ09 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Phtf1Q9QZ09 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Phtf1Q9QZ09 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Phtf1Q9QZ09 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Phtf1Q9QZ09 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Phtf1Q9QZ09 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Phtf1Q9QZ09 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Phtf1Q9QZ09 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Phtf1Q9QZ09 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Phtf1Q9QZ09 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Phtf1Q9QZ09 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Phtf1Q9QZ09 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Phtf1Q9QZ09 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms