Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY23

Pkp3, Plakophilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp3Q9QY23 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkp3Q9QY23 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkp3Q9QY23 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkp3Q9QY23 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkp3Q9QY23 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkp3Q9QY23 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkp3Q9QY23 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkp3Q9QY23 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkp3Q9QY23 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkp3Q9QY23 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkp3Q9QY23 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkp3Q9QY23 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkp3Q9QY23 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkp3Q9QY23 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkp3Q9QY23 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkp3Q9QY23 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkp3Q9QY23 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkp3Q9QY23 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkp3Q9QY23 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkp3Q9QY23 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkp3Q9QY23 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkp3Q9QY23 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkp3Q9QY23 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkp3Q9QY23 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkp3Q9QY23 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkp3Q9QY23 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkp3Q9QY23 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkp3Q9QY23 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkp3Q9QY23 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkp3Q9QY23 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkp3Q9QY23 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkp3Q9QY23 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkp3Q9QY23 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkp3Q9QY23 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkp3Q9QY23 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkp3Q9QY23 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkp3Q9QY23 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkp3Q9QY23 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkp3Q9QY23 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkp3Q9QY23 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkp3Q9QY23 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkp3Q9QY23 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkp3Q9QY23 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkp3Q9QY23 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkp3Q9QY23 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkp3Q9QY23 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkp3Q9QY23 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkp3Q9QY23 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkp3Q9QY23 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkp3Q9QY23 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkp3Q9QY23 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkp3Q9QY23 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkp3Q9QY23 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkp3Q9QY23 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkp3Q9QY23 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkp3Q9QY23 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkp3Q9QY23 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkp3Q9QY23 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkp3Q9QY23 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkp3Q9QY23 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkp3Q9QY23 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkp3Q9QY23 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkp3Q9QY23 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkp3Q9QY23 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkp3Q9QY23 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkp3Q9QY23 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkp3Q9QY23 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkp3Q9QY23 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkp3Q9QY23 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkp3Q9QY23 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkp3Q9QY23 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkp3Q9QY23 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkp3Q9QY23 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkp3Q9QY23 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkp3Q9QY23 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkp3Q9QY23 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkp3Q9QY23 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkp3Q9QY23 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkp3Q9QY23 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkp3Q9QY23 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkp3Q9QY23 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pkp3Q9QY23 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkp3Q9QY23 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkp3Q9QY23 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkp3Q9QY23 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkp3Q9QY23 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkp3Q9QY23 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkp3Q9QY23 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkp3Q9QY23 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkp3Q9QY23 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkp3Q9QY23 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkp3Q9QY23 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkp3Q9QY23 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkp3Q9QY23 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkp3Q9QY23 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkp3Q9QY23 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkp3Q9QY23 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkp3Q9QY23 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkp3Q9QY23 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkp3Q9QY23 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms