Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY14

Foxe3, Forkhead box protein E3, mousemouse

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxe3Q9QY14 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Foxe3Q9QY14 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Foxe3Q9QY14 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Foxe3Q9QY14 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Foxe3Q9QY14 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Foxe3Q9QY14 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Foxe3Q9QY14 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Foxe3Q9QY14 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Foxe3Q9QY14 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Foxe3Q9QY14 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Foxe3Q9QY14 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Foxe3Q9QY14 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Foxe3Q9QY14 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Foxe3Q9QY14 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Foxe3Q9QY14 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Foxe3Q9QY14 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Foxe3Q9QY14 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Foxe3Q9QY14 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Foxe3Q9QY14 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Foxe3Q9QY14 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Foxe3Q9QY14 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Foxe3Q9QY14 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Foxe3Q9QY14 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Foxe3Q9QY14 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Foxe3Q9QY14 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Foxe3Q9QY14 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Foxe3Q9QY14 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Foxe3Q9QY14 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Foxe3Q9QY14 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Foxe3Q9QY14 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Foxe3Q9QY14 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Foxe3Q9QY14 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Foxe3Q9QY14 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Foxe3Q9QY14 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Foxe3Q9QY14 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Foxe3Q9QY14 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Foxe3Q9QY14 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Foxe3Q9QY14 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Foxe3Q9QY14 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Foxe3Q9QY14 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Foxe3Q9QY14 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Foxe3Q9QY14 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Foxe3Q9QY14 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Foxe3Q9QY14 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Foxe3Q9QY14 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Foxe3Q9QY14 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Foxe3Q9QY14 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Foxe3Q9QY14 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Foxe3Q9QY14 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Foxe3Q9QY14 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Foxe3Q9QY14 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Foxe3Q9QY14 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Foxe3Q9QY14 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Foxe3Q9QY14 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Foxe3Q9QY14 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Foxe3Q9QY14 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Foxe3Q9QY14 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Foxe3Q9QY14 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Foxe3Q9QY14 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Foxe3Q9QY14 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Foxe3Q9QY14 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Foxe3Q9QY14 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Foxe3Q9QY14 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Foxe3Q9QY14 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Foxe3Q9QY14 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Foxe3Q9QY14 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Foxe3Q9QY14 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxe3Q9QY14 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxe3Q9QY14 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxe3Q9QY14 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxe3Q9QY14 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Foxe3Q9QY14 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxe3Q9QY14 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxe3Q9QY14 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxe3Q9QY14 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxe3Q9QY14 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxe3Q9QY14 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxe3Q9QY14 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxe3Q9QY14 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxe3Q9QY14 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxe3Q9QY14 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxe3Q9QY14 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxe3Q9QY14 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxe3Q9QY14 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Foxe3Q9QY14 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Foxe3Q9QY14 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Foxe3Q9QY14 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Foxe3Q9QY14 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Foxe3Q9QY14 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Foxe3Q9QY14 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Foxe3Q9QY14 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Foxe3Q9QY14 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Foxe3Q9QY14 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Foxe3Q9QY14 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Foxe3Q9QY14 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Foxe3Q9QY14 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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