Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ7

Nr2e3, Photoreceptor-specific nuclear receptor, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2e3Q9QXZ7 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nr2e3Q9QXZ7 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Nr2e3Q9QXZ7 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nr2e3Q9QXZ7 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nr2e3Q9QXZ7 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nr2e3Q9QXZ7 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nr2e3Q9QXZ7 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nr2e3Q9QXZ7 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Nr2e3Q9QXZ7 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nr2e3Q9QXZ7 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nr2e3Q9QXZ7 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nr2e3Q9QXZ7 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nr2e3Q9QXZ7 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nr2e3Q9QXZ7 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nr2e3Q9QXZ7 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nr2e3Q9QXZ7 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nr2e3Q9QXZ7 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nr2e3Q9QXZ7 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nr2e3Q9QXZ7 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nr2e3Q9QXZ7 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nr2e3Q9QXZ7 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nr2e3Q9QXZ7 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Nr2e3Q9QXZ7 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nr2e3Q9QXZ7 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nr2e3Q9QXZ7 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nr2e3Q9QXZ7 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Nr2e3Q9QXZ7 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nr2e3Q9QXZ7 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nr2e3Q9QXZ7 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nr2e3Q9QXZ7 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nr2e3Q9QXZ7 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Nr2e3Q9QXZ7 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nr2e3Q9QXZ7 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nr2e3Q9QXZ7 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nr2e3Q9QXZ7 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nr2e3Q9QXZ7 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nr2e3Q9QXZ7 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nr2e3Q9QXZ7 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nr2e3Q9QXZ7 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Nr2e3Q9QXZ7 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nr2e3Q9QXZ7 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nr2e3Q9QXZ7 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nr2e3Q9QXZ7 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nr2e3Q9QXZ7 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nr2e3Q9QXZ7 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nr2e3Q9QXZ7 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nr2e3Q9QXZ7 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nr2e3Q9QXZ7 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nr2e3Q9QXZ7 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Nr2e3Q9QXZ7 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nr2e3Q9QXZ7 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nr2e3Q9QXZ7 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nr2e3Q9QXZ7 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nr2e3Q9QXZ7 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nr2e3Q9QXZ7 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nr2e3Q9QXZ7 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nr2e3Q9QXZ7 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nr2e3Q9QXZ7 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nr2e3Q9QXZ7 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nr2e3Q9QXZ7 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nr2e3Q9QXZ7 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nr2e3Q9QXZ7 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nr2e3Q9QXZ7 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nr2e3Q9QXZ7 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nr2e3Q9QXZ7 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nr2e3Q9QXZ7 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Nr2e3Q9QXZ7 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nr2e3Q9QXZ7 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nr2e3Q9QXZ7 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nr2e3Q9QXZ7 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nr2e3Q9QXZ7 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nr2e3Q9QXZ7 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nr2e3Q9QXZ7 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nr2e3Q9QXZ7 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nr2e3Q9QXZ7 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nr2e3Q9QXZ7 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Nr2e3Q9QXZ7 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Nr2e3Q9QXZ7 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nr2e3Q9QXZ7 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nr2e3Q9QXZ7 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nr2e3Q9QXZ7 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nr2e3Q9QXZ7 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nr2e3Q9QXZ7 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nr2e3Q9QXZ7 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nr2e3Q9QXZ7 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Nr2e3Q9QXZ7 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Nr2e3Q9QXZ7 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nr2e3Q9QXZ7 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nr2e3Q9QXZ7 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Nr2e3Q9QXZ7 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nr2e3Q9QXZ7 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nr2e3Q9QXZ7 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nr2e3Q9QXZ7 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nr2e3Q9QXZ7 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nr2e3Q9QXZ7 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nr2e3Q9QXZ7 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nr2e3Q9QXZ7 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nr2e3Q9QXZ7 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nr2e3Q9QXZ7 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nr2e3Q9QXZ7 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 218 ms