Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX29

Trpc5, Short transient receptor potential channel 5, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc5Q9QX29 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trpc5Q9QX29 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trpc5Q9QX29 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trpc5Q9QX29 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trpc5Q9QX29 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trpc5Q9QX29 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trpc5Q9QX29 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trpc5Q9QX29 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trpc5Q9QX29 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trpc5Q9QX29 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trpc5Q9QX29 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trpc5Q9QX29 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trpc5Q9QX29 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trpc5Q9QX29 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trpc5Q9QX29 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trpc5Q9QX29 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trpc5Q9QX29 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trpc5Q9QX29 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Trpc5Q9QX29 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trpc5Q9QX29 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trpc5Q9QX29 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trpc5Q9QX29 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trpc5Q9QX29 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trpc5Q9QX29 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trpc5Q9QX29 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trpc5Q9QX29 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trpc5Q9QX29 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trpc5Q9QX29 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trpc5Q9QX29 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trpc5Q9QX29 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trpc5Q9QX29 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Trpc5Q9QX29 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trpc5Q9QX29 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trpc5Q9QX29 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trpc5Q9QX29 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Trpc5Q9QX29 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trpc5Q9QX29 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trpc5Q9QX29 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trpc5Q9QX29 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trpc5Q9QX29 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trpc5Q9QX29 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trpc5Q9QX29 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trpc5Q9QX29 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trpc5Q9QX29 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trpc5Q9QX29 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trpc5Q9QX29 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trpc5Q9QX29 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trpc5Q9QX29 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trpc5Q9QX29 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trpc5Q9QX29 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trpc5Q9QX29 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trpc5Q9QX29 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trpc5Q9QX29 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Trpc5Q9QX29 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trpc5Q9QX29 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trpc5Q9QX29 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trpc5Q9QX29 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Trpc5Q9QX29 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trpc5Q9QX29 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trpc5Q9QX29 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trpc5Q9QX29 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trpc5Q9QX29 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trpc5Q9QX29 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trpc5Q9QX29 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Trpc5Q9QX29 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trpc5Q9QX29 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trpc5Q9QX29 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trpc5Q9QX29 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trpc5Q9QX29 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trpc5Q9QX29 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trpc5Q9QX29 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trpc5Q9QX29 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trpc5Q9QX29 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trpc5Q9QX29 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Trpc5Q9QX29 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trpc5Q9QX29 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trpc5Q9QX29 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trpc5Q9QX29 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trpc5Q9QX29 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trpc5Q9QX29 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trpc5Q9QX29 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trpc5Q9QX29 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Trpc5Q9QX29 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trpc5Q9QX29 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trpc5Q9QX29 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trpc5Q9QX29 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trpc5Q9QX29 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trpc5Q9QX29 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trpc5Q9QX29 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trpc5Q9QX29 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trpc5Q9QX29 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trpc5Q9QX29 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trpc5Q9QX29 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trpc5Q9QX29 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trpc5Q9QX29 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Trpc5Q9QX29 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trpc5Q9QX29 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Trpc5Q9QX29 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trpc5Q9QX29 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trpc5Q9QX29 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.4 ms