Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWW1

Homer2, Homer protein homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer2Q9QWW1 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Homer2Q9QWW1 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Homer2Q9QWW1 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Homer2Q9QWW1 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Homer2Q9QWW1 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Homer2Q9QWW1 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Homer2Q9QWW1 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Homer2Q9QWW1 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Homer2Q9QWW1 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Homer2Q9QWW1 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Homer2Q9QWW1 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Homer2Q9QWW1 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Homer2Q9QWW1 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Homer2Q9QWW1 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Homer2Q9QWW1 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Homer2Q9QWW1 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Homer2Q9QWW1 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Homer2Q9QWW1 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Homer2Q9QWW1 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Homer2Q9QWW1 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Homer2Q9QWW1 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Homer2Q9QWW1 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Homer2Q9QWW1 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Homer2Q9QWW1 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Homer2Q9QWW1 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Homer2Q9QWW1 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Homer2Q9QWW1 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Homer2Q9QWW1 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Homer2Q9QWW1 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Homer2Q9QWW1 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Homer2Q9QWW1 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Homer2Q9QWW1 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Homer2Q9QWW1 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Homer2Q9QWW1 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Homer2Q9QWW1 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Homer2Q9QWW1 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Homer2Q9QWW1 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Homer2Q9QWW1 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Homer2Q9QWW1 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Homer2Q9QWW1 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Homer2Q9QWW1 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Homer2Q9QWW1 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Homer2Q9QWW1 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Homer2Q9QWW1 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Homer2Q9QWW1 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Homer2Q9QWW1 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Homer2Q9QWW1 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Homer2Q9QWW1 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Homer2Q9QWW1 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Homer2Q9QWW1 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Homer2Q9QWW1 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Homer2Q9QWW1 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Homer2Q9QWW1 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Homer2Q9QWW1 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Homer2Q9QWW1 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Homer2Q9QWW1 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Homer2Q9QWW1 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Homer2Q9QWW1 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Homer2Q9QWW1 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Homer2Q9QWW1 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Homer2Q9QWW1 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Homer2Q9QWW1 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Homer2Q9QWW1 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Homer2Q9QWW1 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Homer2Q9QWW1 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Homer2Q9QWW1 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Homer2Q9QWW1 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Homer2Q9QWW1 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Homer2Q9QWW1 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Homer2Q9QWW1 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Homer2Q9QWW1 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Homer2Q9QWW1 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Homer2Q9QWW1 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Homer2Q9QWW1 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Homer2Q9QWW1 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Homer2Q9QWW1 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Homer2Q9QWW1 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Homer2Q9QWW1 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Homer2Q9QWW1 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Homer2Q9QWW1 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Homer2Q9QWW1 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Homer2Q9QWW1 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Homer2Q9QWW1 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Homer2Q9QWW1 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Homer2Q9QWW1 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Homer2Q9QWW1 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Homer2Q9QWW1 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Homer2Q9QWW1 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Homer2Q9QWW1 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Homer2Q9QWW1 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Homer2Q9QWW1 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Homer2Q9QWW1 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Homer2Q9QWW1 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Homer2Q9QWW1 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Homer2Q9QWW1 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Homer2Q9QWW1 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Homer2Q9QWW1 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Homer2Q9QWW1 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Homer2Q9QWW1 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Homer2Q9QWW1 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.3 ms