Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP8

Chrac1, Chromatin accessibility complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrac1Q9JKP8 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chrac1Q9JKP8 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chrac1Q9JKP8 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chrac1Q9JKP8 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chrac1Q9JKP8 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chrac1Q9JKP8 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chrac1Q9JKP8 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Chrac1Q9JKP8 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chrac1Q9JKP8 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Chrac1Q9JKP8 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chrac1Q9JKP8 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Chrac1Q9JKP8 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chrac1Q9JKP8 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Chrac1Q9JKP8 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chrac1Q9JKP8 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chrac1Q9JKP8 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Chrac1Q9JKP8 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Chrac1Q9JKP8 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Chrac1Q9JKP8 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Chrac1Q9JKP8 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Chrac1Q9JKP8 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Chrac1Q9JKP8 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Chrac1Q9JKP8 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Chrac1Q9JKP8 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Chrac1Q9JKP8 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chrac1Q9JKP8 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chrac1Q9JKP8 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chrac1Q9JKP8 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chrac1Q9JKP8 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chrac1Q9JKP8 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chrac1Q9JKP8 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chrac1Q9JKP8 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chrac1Q9JKP8 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chrac1Q9JKP8 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chrac1Q9JKP8 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chrac1Q9JKP8 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chrac1Q9JKP8 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chrac1Q9JKP8 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chrac1Q9JKP8 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chrac1Q9JKP8 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chrac1Q9JKP8 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chrac1Q9JKP8 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chrac1Q9JKP8 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Chrac1Q9JKP8 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Chrac1Q9JKP8 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chrac1Q9JKP8 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chrac1Q9JKP8 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chrac1Q9JKP8 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chrac1Q9JKP8 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chrac1Q9JKP8 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chrac1Q9JKP8 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chrac1Q9JKP8 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chrac1Q9JKP8 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chrac1Q9JKP8 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chrac1Q9JKP8 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chrac1Q9JKP8 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chrac1Q9JKP8 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chrac1Q9JKP8 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chrac1Q9JKP8 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chrac1Q9JKP8 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chrac1Q9JKP8 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chrac1Q9JKP8 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chrac1Q9JKP8 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chrac1Q9JKP8 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chrac1Q9JKP8 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chrac1Q9JKP8 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Chrac1Q9JKP8 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chrac1Q9JKP8 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chrac1Q9JKP8 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chrac1Q9JKP8 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chrac1Q9JKP8 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chrac1Q9JKP8 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chrac1Q9JKP8 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chrac1Q9JKP8 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chrac1Q9JKP8 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chrac1Q9JKP8 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chrac1Q9JKP8 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chrac1Q9JKP8 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chrac1Q9JKP8 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chrac1Q9JKP8 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chrac1Q9JKP8 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chrac1Q9JKP8 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chrac1Q9JKP8 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chrac1Q9JKP8 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chrac1Q9JKP8 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chrac1Q9JKP8 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chrac1Q9JKP8 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chrac1Q9JKP8 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chrac1Q9JKP8 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chrac1Q9JKP8 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chrac1Q9JKP8 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chrac1Q9JKP8 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Chrac1Q9JKP8 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chrac1Q9JKP8 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chrac1Q9JKP8 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chrac1Q9JKP8 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chrac1Q9JKP8 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chrac1Q9JKP8 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chrac1Q9JKP8 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chrac1Q9JKP8 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms