Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF6

Nectin1, Nectin-1, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin1Q9JKF6 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nectin1Q9JKF6 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nectin1Q9JKF6 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nectin1Q9JKF6 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nectin1Q9JKF6 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nectin1Q9JKF6 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nectin1Q9JKF6 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nectin1Q9JKF6 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nectin1Q9JKF6 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nectin1Q9JKF6 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nectin1Q9JKF6 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nectin1Q9JKF6 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nectin1Q9JKF6 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nectin1Q9JKF6 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nectin1Q9JKF6 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nectin1Q9JKF6 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nectin1Q9JKF6 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nectin1Q9JKF6 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nectin1Q9JKF6 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nectin1Q9JKF6 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nectin1Q9JKF6 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nectin1Q9JKF6 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nectin1Q9JKF6 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nectin1Q9JKF6 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nectin1Q9JKF6 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nectin1Q9JKF6 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nectin1Q9JKF6 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nectin1Q9JKF6 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nectin1Q9JKF6 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Nectin1Q9JKF6 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nectin1Q9JKF6 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nectin1Q9JKF6 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nectin1Q9JKF6 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nectin1Q9JKF6 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nectin1Q9JKF6 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nectin1Q9JKF6 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nectin1Q9JKF6 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nectin1Q9JKF6 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nectin1Q9JKF6 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nectin1Q9JKF6 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nectin1Q9JKF6 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nectin1Q9JKF6 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nectin1Q9JKF6 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nectin1Q9JKF6 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nectin1Q9JKF6 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nectin1Q9JKF6 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nectin1Q9JKF6 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nectin1Q9JKF6 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nectin1Q9JKF6 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nectin1Q9JKF6 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nectin1Q9JKF6 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nectin1Q9JKF6 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nectin1Q9JKF6 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nectin1Q9JKF6 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nectin1Q9JKF6 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nectin1Q9JKF6 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nectin1Q9JKF6 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nectin1Q9JKF6 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nectin1Q9JKF6 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nectin1Q9JKF6 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nectin1Q9JKF6 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nectin1Q9JKF6 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nectin1Q9JKF6 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nectin1Q9JKF6 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nectin1Q9JKF6 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nectin1Q9JKF6 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nectin1Q9JKF6 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nectin1Q9JKF6 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nectin1Q9JKF6 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nectin1Q9JKF6 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nectin1Q9JKF6 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nectin1Q9JKF6 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nectin1Q9JKF6 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nectin1Q9JKF6 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nectin1Q9JKF6 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nectin1Q9JKF6 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nectin1Q9JKF6 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nectin1Q9JKF6 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nectin1Q9JKF6 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nectin1Q9JKF6 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nectin1Q9JKF6 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nectin1Q9JKF6 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nectin1Q9JKF6 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nectin1Q9JKF6 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nectin1Q9JKF6 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nectin1Q9JKF6 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nectin1Q9JKF6 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nectin1Q9JKF6 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nectin1Q9JKF6 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nectin1Q9JKF6 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nectin1Q9JKF6 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nectin1Q9JKF6 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nectin1Q9JKF6 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nectin1Q9JKF6 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nectin1Q9JKF6 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nectin1Q9JKF6 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nectin1Q9JKF6 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nectin1Q9JKF6 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nectin1Q9JKF6 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nectin1Q9JKF6 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms