Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIG7

Ccdc22, Coiled-coil domain-containing protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc22Q9JIG7 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc22Q9JIG7 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc22Q9JIG7 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc22Q9JIG7 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc22Q9JIG7 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc22Q9JIG7 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc22Q9JIG7 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc22Q9JIG7 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc22Q9JIG7 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc22Q9JIG7 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc22Q9JIG7 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc22Q9JIG7 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc22Q9JIG7 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc22Q9JIG7 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc22Q9JIG7 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc22Q9JIG7 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc22Q9JIG7 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc22Q9JIG7 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc22Q9JIG7 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc22Q9JIG7 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc22Q9JIG7 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc22Q9JIG7 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc22Q9JIG7 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc22Q9JIG7 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc22Q9JIG7 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc22Q9JIG7 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc22Q9JIG7 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc22Q9JIG7 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc22Q9JIG7 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc22Q9JIG7 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc22Q9JIG7 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc22Q9JIG7 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc22Q9JIG7 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc22Q9JIG7 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc22Q9JIG7 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc22Q9JIG7 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc22Q9JIG7 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc22Q9JIG7 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc22Q9JIG7 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc22Q9JIG7 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc22Q9JIG7 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc22Q9JIG7 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc22Q9JIG7 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc22Q9JIG7 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc22Q9JIG7 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc22Q9JIG7 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc22Q9JIG7 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc22Q9JIG7 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc22Q9JIG7 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc22Q9JIG7 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc22Q9JIG7 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc22Q9JIG7 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc22Q9JIG7 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc22Q9JIG7 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc22Q9JIG7 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc22Q9JIG7 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc22Q9JIG7 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc22Q9JIG7 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc22Q9JIG7 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc22Q9JIG7 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc22Q9JIG7 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc22Q9JIG7 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc22Q9JIG7 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc22Q9JIG7 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc22Q9JIG7 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc22Q9JIG7 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc22Q9JIG7 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc22Q9JIG7 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc22Q9JIG7 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc22Q9JIG7 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc22Q9JIG7 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc22Q9JIG7 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc22Q9JIG7 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc22Q9JIG7 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc22Q9JIG7 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc22Q9JIG7 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc22Q9JIG7 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc22Q9JIG7 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc22Q9JIG7 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc22Q9JIG7 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc22Q9JIG7 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc22Q9JIG7 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc22Q9JIG7 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc22Q9JIG7 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc22Q9JIG7 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc22Q9JIG7 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc22Q9JIG7 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc22Q9JIG7 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc22Q9JIG7 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc22Q9JIG7 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc22Q9JIG7 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc22Q9JIG7 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc22Q9JIG7 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc22Q9JIG7 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc22Q9JIG7 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc22Q9JIG7 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc22Q9JIG7 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc22Q9JIG7 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc22Q9JIG7 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc22Q9JIG7 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms