Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI57

Gtf2ird1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,104 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2ird1Q9JI57 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gtf2ird1Q9JI57 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gtf2ird1Q9JI57 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gtf2ird1Q9JI57 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gtf2ird1Q9JI57 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gtf2ird1Q9JI57 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gtf2ird1Q9JI57 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gtf2ird1Q9JI57 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gtf2ird1Q9JI57 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gtf2ird1Q9JI57 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gtf2ird1Q9JI57 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gtf2ird1Q9JI57 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gtf2ird1Q9JI57 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gtf2ird1Q9JI57 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gtf2ird1Q9JI57 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gtf2ird1Q9JI57 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gtf2ird1Q9JI57 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gtf2ird1Q9JI57 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Gtf2ird1Q9JI57 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Gtf2ird1Q9JI57 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gtf2ird1Q9JI57 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gtf2ird1Q9JI57 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gtf2ird1Q9JI57 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gtf2ird1Q9JI57 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Gtf2ird1Q9JI57 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gtf2ird1Q9JI57 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Gtf2ird1Q9JI57 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gtf2ird1Q9JI57 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gtf2ird1Q9JI57 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Gtf2ird1Q9JI57 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gtf2ird1Q9JI57 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gtf2ird1Q9JI57 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Gtf2ird1Q9JI57 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gtf2ird1Q9JI57 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gtf2ird1Q9JI57 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Gtf2ird1Q9JI57 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gtf2ird1Q9JI57 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Gtf2ird1Q9JI57 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gtf2ird1Q9JI57 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gtf2ird1Q9JI57 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gtf2ird1Q9JI57 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Gtf2ird1Q9JI57 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Gtf2ird1Q9JI57 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gtf2ird1Q9JI57 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gtf2ird1Q9JI57 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Gtf2ird1Q9JI57 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gtf2ird1Q9JI57 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms