Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET43

Cldn12, Claudin-12, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn12Q9ET43 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn12Q9ET43 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn12Q9ET43 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn12Q9ET43 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn12Q9ET43 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn12Q9ET43 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn12Q9ET43 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Cldn12Q9ET43 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn12Q9ET43 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Cldn12Q9ET43 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Cldn12Q9ET43 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn12Q9ET43 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn12Q9ET43 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn12Q9ET43 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn12Q9ET43 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn12Q9ET43 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Cldn12Q9ET43 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn12Q9ET43 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn12Q9ET43 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn12Q9ET43 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn12Q9ET43 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn12Q9ET43 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn12Q9ET43 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn12Q9ET43 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn12Q9ET43 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Cldn12Q9ET43 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Cldn12Q9ET43 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn12Q9ET43 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn12Q9ET43 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn12Q9ET43 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn12Q9ET43 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn12Q9ET43 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn12Q9ET43 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn12Q9ET43 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn12Q9ET43 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn12Q9ET43 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn12Q9ET43 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn12Q9ET43 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn12Q9ET43 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn12Q9ET43 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Cldn12Q9ET43 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Cldn12Q9ET43 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Cldn12Q9ET43 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn12Q9ET43 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Cldn12Q9ET43 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn12Q9ET43 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn12Q9ET43 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn12Q9ET43 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn12Q9ET43 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn12Q9ET43 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn12Q9ET43 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn12Q9ET43 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn12Q9ET43 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn12Q9ET43 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn12Q9ET43 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn12Q9ET43 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn12Q9ET43 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn12Q9ET43 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn12Q9ET43 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn12Q9ET43 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn12Q9ET43 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn12Q9ET43 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn12Q9ET43 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn12Q9ET43 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn12Q9ET43 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn12Q9ET43 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn12Q9ET43 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn12Q9ET43 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn12Q9ET43 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn12Q9ET43 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn12Q9ET43 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn12Q9ET43 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn12Q9ET43 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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