Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN6

Trim2, Tripartite motif-containing protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 744 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim2Q9ESN6 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim2Q9ESN6 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim2Q9ESN6 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim2Q9ESN6 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim2Q9ESN6 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim2Q9ESN6 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim2Q9ESN6 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim2Q9ESN6 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim2Q9ESN6 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim2Q9ESN6 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim2Q9ESN6 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim2Q9ESN6 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim2Q9ESN6 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim2Q9ESN6 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim2Q9ESN6 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim2Q9ESN6 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim2Q9ESN6 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim2Q9ESN6 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim2Q9ESN6 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim2Q9ESN6 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim2Q9ESN6 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim2Q9ESN6 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim2Q9ESN6 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim2Q9ESN6 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim2Q9ESN6 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim2Q9ESN6 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim2Q9ESN6 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim2Q9ESN6 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim2Q9ESN6 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim2Q9ESN6 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim2Q9ESN6 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim2Q9ESN6 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim2Q9ESN6 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim2Q9ESN6 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim2Q9ESN6 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim2Q9ESN6 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim2Q9ESN6 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim2Q9ESN6 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim2Q9ESN6 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim2Q9ESN6 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim2Q9ESN6 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim2Q9ESN6 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim2Q9ESN6 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim2Q9ESN6 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim2Q9ESN6 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim2Q9ESN6 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim2Q9ESN6 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim2Q9ESN6 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim2Q9ESN6 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim2Q9ESN6 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim2Q9ESN6 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim2Q9ESN6 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim2Q9ESN6 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim2Q9ESN6 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim2Q9ESN6 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim2Q9ESN6 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim2Q9ESN6 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim2Q9ESN6 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim2Q9ESN6 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim2Q9ESN6 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim2Q9ESN6 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim2Q9ESN6 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim2Q9ESN6 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim2Q9ESN6 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim2Q9ESN6 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim2Q9ESN6 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim2Q9ESN6 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim2Q9ESN6 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim2Q9ESN6 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim2Q9ESN6 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim2Q9ESN6 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim2Q9ESN6 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim2Q9ESN6 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim2Q9ESN6 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim2Q9ESN6 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim2Q9ESN6 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim2Q9ESN6 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim2Q9ESN6 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim2Q9ESN6 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim2Q9ESN6 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim2Q9ESN6 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim2Q9ESN6 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim2Q9ESN6 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim2Q9ESN6 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim2Q9ESN6 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim2Q9ESN6 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim2Q9ESN6 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim2Q9ESN6 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim2Q9ESN6 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim2Q9ESN6 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim2Q9ESN6 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim2Q9ESN6 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim2Q9ESN6 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim2Q9ESN6 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim2Q9ESN6 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Trim2Q9ESN6 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Trim2Q9ESN6 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Trim2Q9ESN6 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Trim2Q9ESN6 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
Trim2Q9ESN6 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
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