Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERP3

Trim54, Tripartite motif-containing protein 54, mousemouse

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim54Q9ERP3 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim54Q9ERP3 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim54Q9ERP3 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim54Q9ERP3 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim54Q9ERP3 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim54Q9ERP3 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim54Q9ERP3 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim54Q9ERP3 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim54Q9ERP3 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim54Q9ERP3 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim54Q9ERP3 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim54Q9ERP3 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim54Q9ERP3 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim54Q9ERP3 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim54Q9ERP3 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim54Q9ERP3 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim54Q9ERP3 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim54Q9ERP3 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim54Q9ERP3 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim54Q9ERP3 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim54Q9ERP3 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim54Q9ERP3 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim54Q9ERP3 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim54Q9ERP3 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim54Q9ERP3 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim54Q9ERP3 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim54Q9ERP3 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim54Q9ERP3 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim54Q9ERP3 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim54Q9ERP3 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim54Q9ERP3 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim54Q9ERP3 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim54Q9ERP3 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim54Q9ERP3 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim54Q9ERP3 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim54Q9ERP3 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim54Q9ERP3 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim54Q9ERP3 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim54Q9ERP3 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim54Q9ERP3 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim54Q9ERP3 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim54Q9ERP3 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Trim54Q9ERP3 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Trim54Q9ERP3 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Trim54Q9ERP3 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Trim54Q9ERP3 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Trim54Q9ERP3 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim54Q9ERP3 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim54Q9ERP3 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim54Q9ERP3 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim54Q9ERP3 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim54Q9ERP3 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim54Q9ERP3 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim54Q9ERP3 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim54Q9ERP3 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim54Q9ERP3 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim54Q9ERP3 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim54Q9ERP3 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim54Q9ERP3 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim54Q9ERP3 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim54Q9ERP3 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim54Q9ERP3 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim54Q9ERP3 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim54Q9ERP3 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim54Q9ERP3 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim54Q9ERP3 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim54Q9ERP3 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim54Q9ERP3 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim54Q9ERP3 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim54Q9ERP3 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim54Q9ERP3 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim54Q9ERP3 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim54Q9ERP3 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim54Q9ERP3 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim54Q9ERP3 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim54Q9ERP3 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim54Q9ERP3 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim54Q9ERP3 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim54Q9ERP3 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim54Q9ERP3 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim54Q9ERP3 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim54Q9ERP3 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim54Q9ERP3 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim54Q9ERP3 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim54Q9ERP3 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim54Q9ERP3 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim54Q9ERP3 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim54Q9ERP3 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim54Q9ERP3 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim54Q9ERP3 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim54Q9ERP3 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim54Q9ERP3 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trim54Q9ERP3 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trim54Q9ERP3 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trim54Q9ERP3 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trim54Q9ERP3 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trim54Q9ERP3 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trim54Q9ERP3 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Trim54Q9ERP3 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trim54Q9ERP3 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
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