Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQH7

Ndst3, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 3, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndst3Q9EQH7 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndst3Q9EQH7 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndst3Q9EQH7 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndst3Q9EQH7 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndst3Q9EQH7 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndst3Q9EQH7 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndst3Q9EQH7 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndst3Q9EQH7 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndst3Q9EQH7 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndst3Q9EQH7 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndst3Q9EQH7 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndst3Q9EQH7 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndst3Q9EQH7 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndst3Q9EQH7 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndst3Q9EQH7 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndst3Q9EQH7 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndst3Q9EQH7 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndst3Q9EQH7 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndst3Q9EQH7 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndst3Q9EQH7 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndst3Q9EQH7 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndst3Q9EQH7 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndst3Q9EQH7 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndst3Q9EQH7 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndst3Q9EQH7 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndst3Q9EQH7 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndst3Q9EQH7 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndst3Q9EQH7 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndst3Q9EQH7 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndst3Q9EQH7 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndst3Q9EQH7 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndst3Q9EQH7 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndst3Q9EQH7 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndst3Q9EQH7 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndst3Q9EQH7 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndst3Q9EQH7 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndst3Q9EQH7 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndst3Q9EQH7 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndst3Q9EQH7 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndst3Q9EQH7 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndst3Q9EQH7 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndst3Q9EQH7 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndst3Q9EQH7 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndst3Q9EQH7 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndst3Q9EQH7 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndst3Q9EQH7 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndst3Q9EQH7 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndst3Q9EQH7 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndst3Q9EQH7 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndst3Q9EQH7 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndst3Q9EQH7 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndst3Q9EQH7 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndst3Q9EQH7 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndst3Q9EQH7 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndst3Q9EQH7 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndst3Q9EQH7 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndst3Q9EQH7 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndst3Q9EQH7 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndst3Q9EQH7 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndst3Q9EQH7 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndst3Q9EQH7 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndst3Q9EQH7 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndst3Q9EQH7 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndst3Q9EQH7 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndst3Q9EQH7 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndst3Q9EQH7 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndst3Q9EQH7 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndst3Q9EQH7 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndst3Q9EQH7 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndst3Q9EQH7 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndst3Q9EQH7 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndst3Q9EQH7 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndst3Q9EQH7 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndst3Q9EQH7 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndst3Q9EQH7 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndst3Q9EQH7 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndst3Q9EQH7 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndst3Q9EQH7 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndst3Q9EQH7 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndst3Q9EQH7 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndst3Q9EQH7 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndst3Q9EQH7 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndst3Q9EQH7 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndst3Q9EQH7 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndst3Q9EQH7 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndst3Q9EQH7 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndst3Q9EQH7 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndst3Q9EQH7 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndst3Q9EQH7 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndst3Q9EQH7 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndst3Q9EQH7 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndst3Q9EQH7 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndst3Q9EQH7 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndst3Q9EQH7 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndst3Q9EQH7 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndst3Q9EQH7 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndst3Q9EQH7 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndst3Q9EQH7 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndst3Q9EQH7 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndst3Q9EQH7 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms