Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ16

Cxcr6, C-X-C chemokine receptor type 6, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr6Q9EQ16 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cxcr6Q9EQ16 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cxcr6Q9EQ16 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cxcr6Q9EQ16 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cxcr6Q9EQ16 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cxcr6Q9EQ16 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cxcr6Q9EQ16 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cxcr6Q9EQ16 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cxcr6Q9EQ16 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cxcr6Q9EQ16 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cxcr6Q9EQ16 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cxcr6Q9EQ16 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cxcr6Q9EQ16 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cxcr6Q9EQ16 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cxcr6Q9EQ16 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cxcr6Q9EQ16 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cxcr6Q9EQ16 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cxcr6Q9EQ16 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cxcr6Q9EQ16 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cxcr6Q9EQ16 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cxcr6Q9EQ16 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cxcr6Q9EQ16 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Cxcr6Q9EQ16 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cxcr6Q9EQ16 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cxcr6Q9EQ16 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cxcr6Q9EQ16 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cxcr6Q9EQ16 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cxcr6Q9EQ16 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cxcr6Q9EQ16 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cxcr6Q9EQ16 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cxcr6Q9EQ16 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cxcr6Q9EQ16 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cxcr6Q9EQ16 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cxcr6Q9EQ16 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cxcr6Q9EQ16 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cxcr6Q9EQ16 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cxcr6Q9EQ16 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cxcr6Q9EQ16 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cxcr6Q9EQ16 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cxcr6Q9EQ16 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cxcr6Q9EQ16 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cxcr6Q9EQ16 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cxcr6Q9EQ16 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cxcr6Q9EQ16 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cxcr6Q9EQ16 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cxcr6Q9EQ16 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cxcr6Q9EQ16 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cxcr6Q9EQ16 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cxcr6Q9EQ16 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cxcr6Q9EQ16 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cxcr6Q9EQ16 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cxcr6Q9EQ16 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cxcr6Q9EQ16 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cxcr6Q9EQ16 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cxcr6Q9EQ16 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cxcr6Q9EQ16 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cxcr6Q9EQ16 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cxcr6Q9EQ16 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cxcr6Q9EQ16 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cxcr6Q9EQ16 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cxcr6Q9EQ16 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cxcr6Q9EQ16 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Cxcr6Q9EQ16 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Cxcr6Q9EQ16 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Cxcr6Q9EQ16 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cxcr6Q9EQ16 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cxcr6Q9EQ16 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cxcr6Q9EQ16 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cxcr6Q9EQ16 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cxcr6Q9EQ16 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cxcr6Q9EQ16 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cxcr6Q9EQ16 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cxcr6Q9EQ16 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cxcr6Q9EQ16 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cxcr6Q9EQ16 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cxcr6Q9EQ16 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cxcr6Q9EQ16 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cxcr6Q9EQ16 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cxcr6Q9EQ16 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cxcr6Q9EQ16 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cxcr6Q9EQ16 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cxcr6Q9EQ16 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cxcr6Q9EQ16 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cxcr6Q9EQ16 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cxcr6Q9EQ16 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Cxcr6Q9EQ16 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cxcr6Q9EQ16 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cxcr6Q9EQ16 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cxcr6Q9EQ16 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cxcr6Q9EQ16 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Cxcr6Q9EQ16 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cxcr6Q9EQ16 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cxcr6Q9EQ16 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cxcr6Q9EQ16 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cxcr6Q9EQ16 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cxcr6Q9EQ16 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cxcr6Q9EQ16 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cxcr6Q9EQ16 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cxcr6Q9EQ16 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cxcr6Q9EQ16 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms