Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPM5

Sync, Syncoilin, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SyncQ9EPM5 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SyncQ9EPM5 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SyncQ9EPM5 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SyncQ9EPM5 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SyncQ9EPM5 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SyncQ9EPM5 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SyncQ9EPM5 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SyncQ9EPM5 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SyncQ9EPM5 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SyncQ9EPM5 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SyncQ9EPM5 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SyncQ9EPM5 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SyncQ9EPM5 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SyncQ9EPM5 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SyncQ9EPM5 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SyncQ9EPM5 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SyncQ9EPM5 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SyncQ9EPM5 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SyncQ9EPM5 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SyncQ9EPM5 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SyncQ9EPM5 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SyncQ9EPM5 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SyncQ9EPM5 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SyncQ9EPM5 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SyncQ9EPM5 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SyncQ9EPM5 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SyncQ9EPM5 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SyncQ9EPM5 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SyncQ9EPM5 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SyncQ9EPM5 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SyncQ9EPM5 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SyncQ9EPM5 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SyncQ9EPM5 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SyncQ9EPM5 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SyncQ9EPM5 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SyncQ9EPM5 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SyncQ9EPM5 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SyncQ9EPM5 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SyncQ9EPM5 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SyncQ9EPM5 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SyncQ9EPM5 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SyncQ9EPM5 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SyncQ9EPM5 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SyncQ9EPM5 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SyncQ9EPM5 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SyncQ9EPM5 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SyncQ9EPM5 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SyncQ9EPM5 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SyncQ9EPM5 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SyncQ9EPM5 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SyncQ9EPM5 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SyncQ9EPM5 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SyncQ9EPM5 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SyncQ9EPM5 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SyncQ9EPM5 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SyncQ9EPM5 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SyncQ9EPM5 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SyncQ9EPM5 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SyncQ9EPM5 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SyncQ9EPM5 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SyncQ9EPM5 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SyncQ9EPM5 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SyncQ9EPM5 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SyncQ9EPM5 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SyncQ9EPM5 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SyncQ9EPM5 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SyncQ9EPM5 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SyncQ9EPM5 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SyncQ9EPM5 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SyncQ9EPM5 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SyncQ9EPM5 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SyncQ9EPM5 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SyncQ9EPM5 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SyncQ9EPM5 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SyncQ9EPM5 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SyncQ9EPM5 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SyncQ9EPM5 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SyncQ9EPM5 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SyncQ9EPM5 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SyncQ9EPM5 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SyncQ9EPM5 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SyncQ9EPM5 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SyncQ9EPM5 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SyncQ9EPM5 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SyncQ9EPM5 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SyncQ9EPM5 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SyncQ9EPM5 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SyncQ9EPM5 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SyncQ9EPM5 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SyncQ9EPM5 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SyncQ9EPM5 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SyncQ9EPM5 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SyncQ9EPM5 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SyncQ9EPM5 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SyncQ9EPM5 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SyncQ9EPM5 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SyncQ9EPM5 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SyncQ9EPM5 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SyncQ9EPM5 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SyncQ9EPM5 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms