Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Clstn1Q9EPL2 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Clstn1Q9EPL2 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Clstn1Q9EPL2 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Clstn1Q9EPL2 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Clstn1Q9EPL2 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Clstn1Q9EPL2 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Clstn1Q9EPL2 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Clstn1Q9EPL2 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Clstn1Q9EPL2 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Clstn1Q9EPL2 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Clstn1Q9EPL2 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Clstn1Q9EPL2 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Clstn1Q9EPL2 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Clstn1Q9EPL2 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Clstn1Q9EPL2 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Clstn1Q9EPL2 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Clstn1Q9EPL2 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Clstn1Q9EPL2 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Clstn1Q9EPL2 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Clstn1Q9EPL2 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Clstn1Q9EPL2 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Clstn1Q9EPL2 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Clstn1Q9EPL2 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Clstn1Q9EPL2 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Clstn1Q9EPL2 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Clstn1Q9EPL2 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Clstn1Q9EPL2 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Clstn1Q9EPL2 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Clstn1Q9EPL2 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Clstn1Q9EPL2 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Clstn1Q9EPL2 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Clstn1Q9EPL2 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Clstn1Q9EPL2 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Clstn1Q9EPL2 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Clstn1Q9EPL2 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Clstn1Q9EPL2 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Clstn1Q9EPL2 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Clstn1Q9EPL2 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Clstn1Q9EPL2 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Clstn1Q9EPL2 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Clstn1Q9EPL2 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Clstn1Q9EPL2 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Clstn1Q9EPL2 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Clstn1Q9EPL2 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Clstn1Q9EPL2 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Clstn1Q9EPL2 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Clstn1Q9EPL2 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Clstn1Q9EPL2 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Clstn1Q9EPL2 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Clstn1Q9EPL2 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Clstn1Q9EPL2 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Clstn1Q9EPL2 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Clstn1Q9EPL2 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Clstn1Q9EPL2 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Clstn1Q9EPL2 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Clstn1Q9EPL2 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Clstn1Q9EPL2 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Clstn1Q9EPL2 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Clstn1Q9EPL2 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Clstn1Q9EPL2 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Clstn1Q9EPL2 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Clstn1Q9EPL2 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Clstn1Q9EPL2 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Clstn1Q9EPL2 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Clstn1Q9EPL2 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Clstn1Q9EPL2 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Clstn1Q9EPL2 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Clstn1Q9EPL2 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Clstn1Q9EPL2 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Clstn1Q9EPL2 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Clstn1Q9EPL2 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Clstn1Q9EPL2 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Clstn1Q9EPL2 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Clstn1Q9EPL2 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Clstn1Q9EPL2 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Clstn1Q9EPL2 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Clstn1Q9EPL2 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Clstn1Q9EPL2 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Clstn1Q9EPL2 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Clstn1Q9EPL2 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Clstn1Q9EPL2 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Clstn1Q9EPL2 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Clstn1Q9EPL2 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Clstn1Q9EPL2 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Clstn1Q9EPL2 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Clstn1Q9EPL2 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Clstn1Q9EPL2 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Clstn1Q9EPL2 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Clstn1Q9EPL2 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Clstn1Q9EPL2 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Clstn1Q9EPL2 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Clstn1Q9EPL2 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Clstn1Q9EPL2 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Clstn1Q9EPL2 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Clstn1Q9EPL2 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Clstn1Q9EPL2 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Clstn1Q9EPL2 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Clstn1Q9EPL2 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Clstn1Q9EPL2 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms