Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPK8

Trpv4, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 4, mousemouse

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv4Q9EPK8 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trpv4Q9EPK8 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trpv4Q9EPK8 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trpv4Q9EPK8 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trpv4Q9EPK8 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trpv4Q9EPK8 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trpv4Q9EPK8 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trpv4Q9EPK8 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trpv4Q9EPK8 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trpv4Q9EPK8 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trpv4Q9EPK8 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trpv4Q9EPK8 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trpv4Q9EPK8 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trpv4Q9EPK8 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trpv4Q9EPK8 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trpv4Q9EPK8 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trpv4Q9EPK8 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trpv4Q9EPK8 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trpv4Q9EPK8 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trpv4Q9EPK8 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trpv4Q9EPK8 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trpv4Q9EPK8 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trpv4Q9EPK8 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trpv4Q9EPK8 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trpv4Q9EPK8 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trpv4Q9EPK8 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trpv4Q9EPK8 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trpv4Q9EPK8 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trpv4Q9EPK8 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trpv4Q9EPK8 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trpv4Q9EPK8 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trpv4Q9EPK8 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trpv4Q9EPK8 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trpv4Q9EPK8 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trpv4Q9EPK8 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpv4Q9EPK8 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpv4Q9EPK8 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpv4Q9EPK8 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpv4Q9EPK8 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpv4Q9EPK8 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpv4Q9EPK8 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpv4Q9EPK8 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpv4Q9EPK8 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpv4Q9EPK8 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpv4Q9EPK8 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpv4Q9EPK8 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpv4Q9EPK8 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpv4Q9EPK8 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpv4Q9EPK8 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpv4Q9EPK8 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpv4Q9EPK8 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpv4Q9EPK8 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpv4Q9EPK8 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpv4Q9EPK8 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpv4Q9EPK8 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpv4Q9EPK8 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpv4Q9EPK8 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpv4Q9EPK8 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpv4Q9EPK8 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpv4Q9EPK8 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpv4Q9EPK8 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpv4Q9EPK8 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpv4Q9EPK8 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trpv4Q9EPK8 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trpv4Q9EPK8 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trpv4Q9EPK8 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trpv4Q9EPK8 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trpv4Q9EPK8 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trpv4Q9EPK8 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trpv4Q9EPK8 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trpv4Q9EPK8 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trpv4Q9EPK8 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trpv4Q9EPK8 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trpv4Q9EPK8 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trpv4Q9EPK8 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Trpv4Q9EPK8 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trpv4Q9EPK8 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trpv4Q9EPK8 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trpv4Q9EPK8 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trpv4Q9EPK8 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trpv4Q9EPK8 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trpv4Q9EPK8 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trpv4Q9EPK8 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trpv4Q9EPK8 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trpv4Q9EPK8 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trpv4Q9EPK8 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trpv4Q9EPK8 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trpv4Q9EPK8 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trpv4Q9EPK8 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trpv4Q9EPK8 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trpv4Q9EPK8 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trpv4Q9EPK8 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trpv4Q9EPK8 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trpv4Q9EPK8 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trpv4Q9EPK8 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trpv4Q9EPK8 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trpv4Q9EPK8 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trpv4Q9EPK8 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trpv4Q9EPK8 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trpv4Q9EPK8 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms