Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCP2

Slc38a3, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 3, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc38a3Q9DCP2 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Slc38a3Q9DCP2 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Slc38a3Q9DCP2 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Slc38a3Q9DCP2 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Slc38a3Q9DCP2 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Slc38a3Q9DCP2 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Slc38a3Q9DCP2 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Slc38a3Q9DCP2 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Slc38a3Q9DCP2 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Slc38a3Q9DCP2 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Slc38a3Q9DCP2 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Slc38a3Q9DCP2 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Slc38a3Q9DCP2 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Slc38a3Q9DCP2 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Slc38a3Q9DCP2 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Slc38a3Q9DCP2 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Slc38a3Q9DCP2 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Slc38a3Q9DCP2 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Slc38a3Q9DCP2 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Slc38a3Q9DCP2 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Slc38a3Q9DCP2 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Slc38a3Q9DCP2 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Slc38a3Q9DCP2 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Slc38a3Q9DCP2 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Slc38a3Q9DCP2 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Slc38a3Q9DCP2 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Slc38a3Q9DCP2 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Slc38a3Q9DCP2 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Slc38a3Q9DCP2 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Slc38a3Q9DCP2 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Slc38a3Q9DCP2 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Slc38a3Q9DCP2 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Slc38a3Q9DCP2 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Slc38a3Q9DCP2 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Slc38a3Q9DCP2 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Slc38a3Q9DCP2 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Slc38a3Q9DCP2 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Slc38a3Q9DCP2 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Slc38a3Q9DCP2 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Slc38a3Q9DCP2 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Slc38a3Q9DCP2 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Slc38a3Q9DCP2 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Slc38a3Q9DCP2 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Slc38a3Q9DCP2 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Slc38a3Q9DCP2 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Slc38a3Q9DCP2 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Slc38a3Q9DCP2 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Slc38a3Q9DCP2 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Slc38a3Q9DCP2 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Slc38a3Q9DCP2 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Slc38a3Q9DCP2 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Slc38a3Q9DCP2 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Slc38a3Q9DCP2 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Slc38a3Q9DCP2 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Slc38a3Q9DCP2 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Slc38a3Q9DCP2 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Slc38a3Q9DCP2 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Slc38a3Q9DCP2 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Slc38a3Q9DCP2 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Slc38a3Q9DCP2 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Slc38a3Q9DCP2 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Slc38a3Q9DCP2 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Slc38a3Q9DCP2 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Slc38a3Q9DCP2 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Slc38a3Q9DCP2 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Slc38a3Q9DCP2 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Slc38a3Q9DCP2 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Slc38a3Q9DCP2 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Slc38a3Q9DCP2 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Slc38a3Q9DCP2 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Slc38a3Q9DCP2 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Slc38a3Q9DCP2 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Slc38a3Q9DCP2 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Slc38a3Q9DCP2 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Slc38a3Q9DCP2 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Slc38a3Q9DCP2 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Slc38a3Q9DCP2 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Slc38a3Q9DCP2 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Slc38a3Q9DCP2 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Slc38a3Q9DCP2 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Slc38a3Q9DCP2 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Slc38a3Q9DCP2 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Slc38a3Q9DCP2 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Slc38a3Q9DCP2 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Slc38a3Q9DCP2 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Slc38a3Q9DCP2 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Slc38a3Q9DCP2 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Slc38a3Q9DCP2 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Slc38a3Q9DCP2 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Slc38a3Q9DCP2 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Slc38a3Q9DCP2 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Slc38a3Q9DCP2 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Slc38a3Q9DCP2 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Slc38a3Q9DCP2 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Slc38a3Q9DCP2 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Slc38a3Q9DCP2 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Slc38a3Q9DCP2 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Slc38a3Q9DCP2 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Slc38a3Q9DCP2 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Slc38a3Q9DCP2 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms