Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC28

Csnk1d, Casein kinase I isoform delta, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1dQ9DC28 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csnk1dQ9DC28 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csnk1dQ9DC28 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csnk1dQ9DC28 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csnk1dQ9DC28 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csnk1dQ9DC28 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csnk1dQ9DC28 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csnk1dQ9DC28 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Csnk1dQ9DC28 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csnk1dQ9DC28 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csnk1dQ9DC28 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csnk1dQ9DC28 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csnk1dQ9DC28 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csnk1dQ9DC28 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csnk1dQ9DC28 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csnk1dQ9DC28 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csnk1dQ9DC28 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csnk1dQ9DC28 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csnk1dQ9DC28 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Csnk1dQ9DC28 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Csnk1dQ9DC28 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csnk1dQ9DC28 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csnk1dQ9DC28 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csnk1dQ9DC28 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csnk1dQ9DC28 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csnk1dQ9DC28 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csnk1dQ9DC28 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csnk1dQ9DC28 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csnk1dQ9DC28 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csnk1dQ9DC28 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csnk1dQ9DC28 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csnk1dQ9DC28 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csnk1dQ9DC28 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Csnk1dQ9DC28 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csnk1dQ9DC28 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csnk1dQ9DC28 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csnk1dQ9DC28 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csnk1dQ9DC28 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csnk1dQ9DC28 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csnk1dQ9DC28 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csnk1dQ9DC28 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csnk1dQ9DC28 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csnk1dQ9DC28 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csnk1dQ9DC28 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csnk1dQ9DC28 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csnk1dQ9DC28 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csnk1dQ9DC28 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csnk1dQ9DC28 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csnk1dQ9DC28 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csnk1dQ9DC28 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csnk1dQ9DC28 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csnk1dQ9DC28 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csnk1dQ9DC28 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csnk1dQ9DC28 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Csnk1dQ9DC28 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Csnk1dQ9DC28 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Csnk1dQ9DC28 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Csnk1dQ9DC28 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Csnk1dQ9DC28 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Csnk1dQ9DC28 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Csnk1dQ9DC28 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Csnk1dQ9DC28 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Csnk1dQ9DC28 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Csnk1dQ9DC28 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Csnk1dQ9DC28 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Csnk1dQ9DC28 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Csnk1dQ9DC28 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Csnk1dQ9DC28 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Csnk1dQ9DC28 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Csnk1dQ9DC28 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Csnk1dQ9DC28 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Csnk1dQ9DC28 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Csnk1dQ9DC28 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Csnk1dQ9DC28 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Csnk1dQ9DC28 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Csnk1dQ9DC28 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Csnk1dQ9DC28 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Csnk1dQ9DC28 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Csnk1dQ9DC28 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Csnk1dQ9DC28 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Csnk1dQ9DC28 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Csnk1dQ9DC28 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Csnk1dQ9DC28 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Csnk1dQ9DC28 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Csnk1dQ9DC28 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Csnk1dQ9DC28 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Csnk1dQ9DC28 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Csnk1dQ9DC28 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csnk1dQ9DC28 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csnk1dQ9DC28 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csnk1dQ9DC28 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csnk1dQ9DC28 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csnk1dQ9DC28 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csnk1dQ9DC28 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csnk1dQ9DC28 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csnk1dQ9DC28 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csnk1dQ9DC28 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csnk1dQ9DC28 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csnk1dQ9DC28 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csnk1dQ9DC28 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.5 ms