Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc97Q9DBT3 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc97Q9DBT3 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc97Q9DBT3 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc97Q9DBT3 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc97Q9DBT3 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc97Q9DBT3 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc97Q9DBT3 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc97Q9DBT3 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc97Q9DBT3 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc97Q9DBT3 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc97Q9DBT3 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc97Q9DBT3 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc97Q9DBT3 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc97Q9DBT3 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc97Q9DBT3 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc97Q9DBT3 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc97Q9DBT3 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc97Q9DBT3 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc97Q9DBT3 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc97Q9DBT3 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc97Q9DBT3 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc97Q9DBT3 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc97Q9DBT3 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc97Q9DBT3 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc97Q9DBT3 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc97Q9DBT3 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc97Q9DBT3 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc97Q9DBT3 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc97Q9DBT3 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc97Q9DBT3 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc97Q9DBT3 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc97Q9DBT3 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc97Q9DBT3 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc97Q9DBT3 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc97Q9DBT3 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc97Q9DBT3 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc97Q9DBT3 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc97Q9DBT3 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc97Q9DBT3 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc97Q9DBT3 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc97Q9DBT3 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc97Q9DBT3 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc97Q9DBT3 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc97Q9DBT3 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc97Q9DBT3 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc97Q9DBT3 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc97Q9DBT3 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc97Q9DBT3 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc97Q9DBT3 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc97Q9DBT3 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc97Q9DBT3 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc97Q9DBT3 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc97Q9DBT3 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc97Q9DBT3 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc97Q9DBT3 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc97Q9DBT3 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc97Q9DBT3 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc97Q9DBT3 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc97Q9DBT3 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc97Q9DBT3 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc97Q9DBT3 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc97Q9DBT3 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc97Q9DBT3 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc97Q9DBT3 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc97Q9DBT3 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc97Q9DBT3 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc97Q9DBT3 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc97Q9DBT3 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc97Q9DBT3 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc97Q9DBT3 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc97Q9DBT3 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc97Q9DBT3 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc97Q9DBT3 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc97Q9DBT3 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc97Q9DBT3 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc97Q9DBT3 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc97Q9DBT3 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc97Q9DBT3 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc97Q9DBT3 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc97Q9DBT3 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc97Q9DBT3 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc97Q9DBT3 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc97Q9DBT3 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc97Q9DBT3 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc97Q9DBT3 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc97Q9DBT3 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc97Q9DBT3 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc97Q9DBT3 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc97Q9DBT3 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc97Q9DBT3 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc97Q9DBT3 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc97Q9DBT3 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc97Q9DBT3 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc97Q9DBT3 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc97Q9DBT3 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc97Q9DBT3 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc97Q9DBT3 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc97Q9DBT3 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc97Q9DBT3 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms