Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAW9

Cnn3, Calponin-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn3Q9DAW9 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cnn3Q9DAW9 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cnn3Q9DAW9 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cnn3Q9DAW9 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cnn3Q9DAW9 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cnn3Q9DAW9 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cnn3Q9DAW9 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cnn3Q9DAW9 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cnn3Q9DAW9 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cnn3Q9DAW9 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cnn3Q9DAW9 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cnn3Q9DAW9 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cnn3Q9DAW9 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cnn3Q9DAW9 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cnn3Q9DAW9 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Cnn3Q9DAW9 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cnn3Q9DAW9 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Cnn3Q9DAW9 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cnn3Q9DAW9 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cnn3Q9DAW9 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cnn3Q9DAW9 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Cnn3Q9DAW9 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cnn3Q9DAW9 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cnn3Q9DAW9 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cnn3Q9DAW9 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cnn3Q9DAW9 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cnn3Q9DAW9 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cnn3Q9DAW9 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cnn3Q9DAW9 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cnn3Q9DAW9 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cnn3Q9DAW9 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cnn3Q9DAW9 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cnn3Q9DAW9 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cnn3Q9DAW9 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cnn3Q9DAW9 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cnn3Q9DAW9 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cnn3Q9DAW9 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cnn3Q9DAW9 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cnn3Q9DAW9 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cnn3Q9DAW9 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cnn3Q9DAW9 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cnn3Q9DAW9 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cnn3Q9DAW9 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cnn3Q9DAW9 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cnn3Q9DAW9 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cnn3Q9DAW9 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cnn3Q9DAW9 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cnn3Q9DAW9 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cnn3Q9DAW9 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cnn3Q9DAW9 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cnn3Q9DAW9 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cnn3Q9DAW9 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Cnn3Q9DAW9 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Cnn3Q9DAW9 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cnn3Q9DAW9 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cnn3Q9DAW9 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Cnn3Q9DAW9 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cnn3Q9DAW9 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cnn3Q9DAW9 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cnn3Q9DAW9 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cnn3Q9DAW9 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cnn3Q9DAW9 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cnn3Q9DAW9 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cnn3Q9DAW9 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cnn3Q9DAW9 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cnn3Q9DAW9 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cnn3Q9DAW9 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cnn3Q9DAW9 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cnn3Q9DAW9 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cnn3Q9DAW9 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cnn3Q9DAW9 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cnn3Q9DAW9 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cnn3Q9DAW9 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cnn3Q9DAW9 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cnn3Q9DAW9 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cnn3Q9DAW9 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cnn3Q9DAW9 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cnn3Q9DAW9 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cnn3Q9DAW9 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cnn3Q9DAW9 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cnn3Q9DAW9 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cnn3Q9DAW9 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cnn3Q9DAW9 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cnn3Q9DAW9 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cnn3Q9DAW9 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cnn3Q9DAW9 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Cnn3Q9DAW9 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cnn3Q9DAW9 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Cnn3Q9DAW9 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Cnn3Q9DAW9 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Cnn3Q9DAW9 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Cnn3Q9DAW9 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Cnn3Q9DAW9 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cnn3Q9DAW9 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Cnn3Q9DAW9 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Cnn3Q9DAW9 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Cnn3Q9DAW9 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Cnn3Q9DAW9 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Cnn3Q9DAW9 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Cnn3Q9DAW9 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms