Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA08

Sgf29, SAGA-associated factor 29, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgf29Q9DA08 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sgf29Q9DA08 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Sgf29Q9DA08 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sgf29Q9DA08 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sgf29Q9DA08 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sgf29Q9DA08 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sgf29Q9DA08 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sgf29Q9DA08 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sgf29Q9DA08 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sgf29Q9DA08 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sgf29Q9DA08 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sgf29Q9DA08 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sgf29Q9DA08 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sgf29Q9DA08 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sgf29Q9DA08 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sgf29Q9DA08 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sgf29Q9DA08 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sgf29Q9DA08 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sgf29Q9DA08 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sgf29Q9DA08 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sgf29Q9DA08 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sgf29Q9DA08 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sgf29Q9DA08 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sgf29Q9DA08 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sgf29Q9DA08 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sgf29Q9DA08 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sgf29Q9DA08 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sgf29Q9DA08 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sgf29Q9DA08 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sgf29Q9DA08 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sgf29Q9DA08 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sgf29Q9DA08 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sgf29Q9DA08 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sgf29Q9DA08 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sgf29Q9DA08 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sgf29Q9DA08 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sgf29Q9DA08 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sgf29Q9DA08 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sgf29Q9DA08 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sgf29Q9DA08 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Sgf29Q9DA08 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sgf29Q9DA08 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sgf29Q9DA08 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sgf29Q9DA08 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sgf29Q9DA08 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sgf29Q9DA08 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sgf29Q9DA08 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sgf29Q9DA08 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sgf29Q9DA08 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sgf29Q9DA08 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sgf29Q9DA08 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sgf29Q9DA08 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sgf29Q9DA08 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sgf29Q9DA08 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sgf29Q9DA08 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sgf29Q9DA08 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sgf29Q9DA08 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sgf29Q9DA08 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sgf29Q9DA08 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sgf29Q9DA08 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sgf29Q9DA08 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sgf29Q9DA08 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sgf29Q9DA08 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sgf29Q9DA08 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sgf29Q9DA08 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sgf29Q9DA08 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sgf29Q9DA08 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sgf29Q9DA08 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sgf29Q9DA08 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sgf29Q9DA08 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sgf29Q9DA08 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sgf29Q9DA08 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Sgf29Q9DA08 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sgf29Q9DA08 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sgf29Q9DA08 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sgf29Q9DA08 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sgf29Q9DA08 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sgf29Q9DA08 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sgf29Q9DA08 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sgf29Q9DA08 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sgf29Q9DA08 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sgf29Q9DA08 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sgf29Q9DA08 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sgf29Q9DA08 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sgf29Q9DA08 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sgf29Q9DA08 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sgf29Q9DA08 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sgf29Q9DA08 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sgf29Q9DA08 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sgf29Q9DA08 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sgf29Q9DA08 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sgf29Q9DA08 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sgf29Q9DA08 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sgf29Q9DA08 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sgf29Q9DA08 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sgf29Q9DA08 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sgf29Q9DA08 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sgf29Q9DA08 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sgf29Q9DA08 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sgf29Q9DA08 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms