Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9L5

Actrt2, Actin-related protein T2, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actrt2Q9D9L5 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Actrt2Q9D9L5 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Actrt2Q9D9L5 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Actrt2Q9D9L5 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Actrt2Q9D9L5 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Actrt2Q9D9L5 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Actrt2Q9D9L5 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Actrt2Q9D9L5 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Actrt2Q9D9L5 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Actrt2Q9D9L5 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Actrt2Q9D9L5 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Actrt2Q9D9L5 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Actrt2Q9D9L5 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Actrt2Q9D9L5 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Actrt2Q9D9L5 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Actrt2Q9D9L5 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Actrt2Q9D9L5 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Actrt2Q9D9L5 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Actrt2Q9D9L5 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Actrt2Q9D9L5 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Actrt2Q9D9L5 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Actrt2Q9D9L5 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Actrt2Q9D9L5 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Actrt2Q9D9L5 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Actrt2Q9D9L5 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Actrt2Q9D9L5 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Actrt2Q9D9L5 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Actrt2Q9D9L5 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Actrt2Q9D9L5 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Actrt2Q9D9L5 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Actrt2Q9D9L5 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Actrt2Q9D9L5 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Actrt2Q9D9L5 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Actrt2Q9D9L5 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Actrt2Q9D9L5 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Actrt2Q9D9L5 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Actrt2Q9D9L5 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Actrt2Q9D9L5 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Actrt2Q9D9L5 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Actrt2Q9D9L5 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Actrt2Q9D9L5 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Actrt2Q9D9L5 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Actrt2Q9D9L5 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Actrt2Q9D9L5 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Actrt2Q9D9L5 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Actrt2Q9D9L5 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Actrt2Q9D9L5 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Actrt2Q9D9L5 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Actrt2Q9D9L5 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Actrt2Q9D9L5 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Actrt2Q9D9L5 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Actrt2Q9D9L5 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Actrt2Q9D9L5 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Actrt2Q9D9L5 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Actrt2Q9D9L5 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Actrt2Q9D9L5 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Actrt2Q9D9L5 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Actrt2Q9D9L5 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Actrt2Q9D9L5 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Actrt2Q9D9L5 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Actrt2Q9D9L5 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Actrt2Q9D9L5 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Actrt2Q9D9L5 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Actrt2Q9D9L5 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Actrt2Q9D9L5 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Actrt2Q9D9L5 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Actrt2Q9D9L5 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Actrt2Q9D9L5 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Actrt2Q9D9L5 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Actrt2Q9D9L5 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Actrt2Q9D9L5 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Actrt2Q9D9L5 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Actrt2Q9D9L5 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Actrt2Q9D9L5 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Actrt2Q9D9L5 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Actrt2Q9D9L5 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Actrt2Q9D9L5 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Actrt2Q9D9L5 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Actrt2Q9D9L5 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Actrt2Q9D9L5 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Actrt2Q9D9L5 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Actrt2Q9D9L5 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Actrt2Q9D9L5 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Actrt2Q9D9L5 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Actrt2Q9D9L5 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Actrt2Q9D9L5 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Actrt2Q9D9L5 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Actrt2Q9D9L5 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Actrt2Q9D9L5 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Actrt2Q9D9L5 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Actrt2Q9D9L5 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Actrt2Q9D9L5 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Actrt2Q9D9L5 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Actrt2Q9D9L5 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Actrt2Q9D9L5 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Actrt2Q9D9L5 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Actrt2Q9D9L5 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Actrt2Q9D9L5 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Actrt2Q9D9L5 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Actrt2Q9D9L5 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms