Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gtf3c6Q9D8P7 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gtf3c6Q9D8P7 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtf3c6Q9D8P7 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gtf3c6Q9D8P7 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gtf3c6Q9D8P7 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Gtf3c6Q9D8P7 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Gtf3c6Q9D8P7 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gtf3c6Q9D8P7 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gtf3c6Q9D8P7 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms