Protein–RNA interactions for Protein: Q9D816

Cyp2c55, Cytochrome P450 2C55, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2c55Q9D816 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cyp2c55Q9D816 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cyp2c55Q9D816 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cyp2c55Q9D816 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cyp2c55Q9D816 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cyp2c55Q9D816 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cyp2c55Q9D816 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cyp2c55Q9D816 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cyp2c55Q9D816 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cyp2c55Q9D816 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cyp2c55Q9D816 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cyp2c55Q9D816 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cyp2c55Q9D816 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cyp2c55Q9D816 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cyp2c55Q9D816 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cyp2c55Q9D816 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cyp2c55Q9D816 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cyp2c55Q9D816 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cyp2c55Q9D816 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cyp2c55Q9D816 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cyp2c55Q9D816 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cyp2c55Q9D816 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cyp2c55Q9D816 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cyp2c55Q9D816 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cyp2c55Q9D816 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cyp2c55Q9D816 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cyp2c55Q9D816 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cyp2c55Q9D816 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cyp2c55Q9D816 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cyp2c55Q9D816 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cyp2c55Q9D816 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cyp2c55Q9D816 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cyp2c55Q9D816 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cyp2c55Q9D816 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cyp2c55Q9D816 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cyp2c55Q9D816 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cyp2c55Q9D816 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cyp2c55Q9D816 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cyp2c55Q9D816 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cyp2c55Q9D816 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cyp2c55Q9D816 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cyp2c55Q9D816 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cyp2c55Q9D816 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cyp2c55Q9D816 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cyp2c55Q9D816 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cyp2c55Q9D816 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cyp2c55Q9D816 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cyp2c55Q9D816 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cyp2c55Q9D816 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cyp2c55Q9D816 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cyp2c55Q9D816 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cyp2c55Q9D816 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cyp2c55Q9D816 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cyp2c55Q9D816 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cyp2c55Q9D816 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cyp2c55Q9D816 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cyp2c55Q9D816 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cyp2c55Q9D816 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cyp2c55Q9D816 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cyp2c55Q9D816 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cyp2c55Q9D816 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cyp2c55Q9D816 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cyp2c55Q9D816 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cyp2c55Q9D816 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cyp2c55Q9D816 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cyp2c55Q9D816 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cyp2c55Q9D816 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cyp2c55Q9D816 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cyp2c55Q9D816 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cyp2c55Q9D816 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cyp2c55Q9D816 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cyp2c55Q9D816 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cyp2c55Q9D816 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cyp2c55Q9D816 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cyp2c55Q9D816 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cyp2c55Q9D816 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cyp2c55Q9D816 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cyp2c55Q9D816 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cyp2c55Q9D816 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cyp2c55Q9D816 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cyp2c55Q9D816 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cyp2c55Q9D816 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cyp2c55Q9D816 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cyp2c55Q9D816 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cyp2c55Q9D816 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cyp2c55Q9D816 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cyp2c55Q9D816 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cyp2c55Q9D816 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cyp2c55Q9D816 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cyp2c55Q9D816 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cyp2c55Q9D816 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cyp2c55Q9D816 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cyp2c55Q9D816 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cyp2c55Q9D816 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cyp2c55Q9D816 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cyp2c55Q9D816 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cyp2c55Q9D816 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cyp2c55Q9D816 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cyp2c55Q9D816 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cyp2c55Q9D816 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms