Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6E4

Ttc9b, Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9bQ9D6E4 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttc9bQ9D6E4 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttc9bQ9D6E4 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttc9bQ9D6E4 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttc9bQ9D6E4 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttc9bQ9D6E4 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttc9bQ9D6E4 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttc9bQ9D6E4 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttc9bQ9D6E4 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttc9bQ9D6E4 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ttc9bQ9D6E4 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttc9bQ9D6E4 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttc9bQ9D6E4 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttc9bQ9D6E4 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttc9bQ9D6E4 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttc9bQ9D6E4 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttc9bQ9D6E4 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttc9bQ9D6E4 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttc9bQ9D6E4 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttc9bQ9D6E4 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttc9bQ9D6E4 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttc9bQ9D6E4 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttc9bQ9D6E4 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttc9bQ9D6E4 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttc9bQ9D6E4 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttc9bQ9D6E4 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttc9bQ9D6E4 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttc9bQ9D6E4 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttc9bQ9D6E4 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttc9bQ9D6E4 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttc9bQ9D6E4 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttc9bQ9D6E4 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttc9bQ9D6E4 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttc9bQ9D6E4 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttc9bQ9D6E4 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttc9bQ9D6E4 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttc9bQ9D6E4 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttc9bQ9D6E4 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttc9bQ9D6E4 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttc9bQ9D6E4 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttc9bQ9D6E4 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttc9bQ9D6E4 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttc9bQ9D6E4 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttc9bQ9D6E4 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttc9bQ9D6E4 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttc9bQ9D6E4 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttc9bQ9D6E4 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttc9bQ9D6E4 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttc9bQ9D6E4 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttc9bQ9D6E4 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttc9bQ9D6E4 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttc9bQ9D6E4 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttc9bQ9D6E4 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttc9bQ9D6E4 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttc9bQ9D6E4 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttc9bQ9D6E4 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttc9bQ9D6E4 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttc9bQ9D6E4 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttc9bQ9D6E4 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttc9bQ9D6E4 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttc9bQ9D6E4 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttc9bQ9D6E4 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttc9bQ9D6E4 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttc9bQ9D6E4 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttc9bQ9D6E4 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttc9bQ9D6E4 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttc9bQ9D6E4 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttc9bQ9D6E4 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttc9bQ9D6E4 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ttc9bQ9D6E4 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ttc9bQ9D6E4 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ttc9bQ9D6E4 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ttc9bQ9D6E4 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ttc9bQ9D6E4 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ttc9bQ9D6E4 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ttc9bQ9D6E4 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ttc9bQ9D6E4 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ttc9bQ9D6E4 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ttc9bQ9D6E4 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ttc9bQ9D6E4 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ttc9bQ9D6E4 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ttc9bQ9D6E4 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ttc9bQ9D6E4 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ttc9bQ9D6E4 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ttc9bQ9D6E4 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ttc9bQ9D6E4 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ttc9bQ9D6E4 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ttc9bQ9D6E4 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ttc9bQ9D6E4 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ttc9bQ9D6E4 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttc9bQ9D6E4 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttc9bQ9D6E4 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttc9bQ9D6E4 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttc9bQ9D6E4 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttc9bQ9D6E4 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttc9bQ9D6E4 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttc9bQ9D6E4 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttc9bQ9D6E4 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttc9bQ9D6E4 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttc9bQ9D6E4 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms