Protein–RNA interactions for Protein: Q9D662

Sec23b, Protein transport protein Sec23B, mousemouse

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Length 767 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23bQ9D662 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec23bQ9D662 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec23bQ9D662 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec23bQ9D662 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec23bQ9D662 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec23bQ9D662 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec23bQ9D662 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec23bQ9D662 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec23bQ9D662 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec23bQ9D662 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec23bQ9D662 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec23bQ9D662 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec23bQ9D662 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec23bQ9D662 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec23bQ9D662 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec23bQ9D662 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec23bQ9D662 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec23bQ9D662 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec23bQ9D662 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec23bQ9D662 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec23bQ9D662 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec23bQ9D662 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec23bQ9D662 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec23bQ9D662 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec23bQ9D662 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec23bQ9D662 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec23bQ9D662 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec23bQ9D662 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec23bQ9D662 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec23bQ9D662 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec23bQ9D662 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec23bQ9D662 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec23bQ9D662 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec23bQ9D662 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec23bQ9D662 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec23bQ9D662 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec23bQ9D662 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec23bQ9D662 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec23bQ9D662 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec23bQ9D662 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec23bQ9D662 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec23bQ9D662 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec23bQ9D662 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec23bQ9D662 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec23bQ9D662 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sec23bQ9D662 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sec23bQ9D662 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sec23bQ9D662 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sec23bQ9D662 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sec23bQ9D662 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sec23bQ9D662 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sec23bQ9D662 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sec23bQ9D662 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sec23bQ9D662 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Sec23bQ9D662 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sec23bQ9D662 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Sec23bQ9D662 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sec23bQ9D662 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sec23bQ9D662 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sec23bQ9D662 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sec23bQ9D662 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sec23bQ9D662 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sec23bQ9D662 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Sec23bQ9D662 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sec23bQ9D662 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sec23bQ9D662 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sec23bQ9D662 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sec23bQ9D662 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sec23bQ9D662 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sec23bQ9D662 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sec23bQ9D662 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sec23bQ9D662 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sec23bQ9D662 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sec23bQ9D662 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sec23bQ9D662 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sec23bQ9D662 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sec23bQ9D662 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sec23bQ9D662 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sec23bQ9D662 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sec23bQ9D662 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sec23bQ9D662 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sec23bQ9D662 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sec23bQ9D662 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sec23bQ9D662 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sec23bQ9D662 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sec23bQ9D662 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sec23bQ9D662 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sec23bQ9D662 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sec23bQ9D662 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sec23bQ9D662 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sec23bQ9D662 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sec23bQ9D662 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sec23bQ9D662 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sec23bQ9D662 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sec23bQ9D662 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sec23bQ9D662 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sec23bQ9D662 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sec23bQ9D662 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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