Protein–RNA interactions for Protein: Q9D620

Rab11fip1, Rab11 family-interacting protein 1, mousemouse

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Length 645 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip1Q9D620 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab11fip1Q9D620 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab11fip1Q9D620 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab11fip1Q9D620 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab11fip1Q9D620 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab11fip1Q9D620 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab11fip1Q9D620 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Rab11fip1Q9D620 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab11fip1Q9D620 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab11fip1Q9D620 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab11fip1Q9D620 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab11fip1Q9D620 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab11fip1Q9D620 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab11fip1Q9D620 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab11fip1Q9D620 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab11fip1Q9D620 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab11fip1Q9D620 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab11fip1Q9D620 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab11fip1Q9D620 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab11fip1Q9D620 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
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Rab11fip1Q9D620 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Rab11fip1Q9D620 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
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Rab11fip1Q9D620 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab11fip1Q9D620 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Rab11fip1Q9D620 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Rab11fip1Q9D620 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab11fip1Q9D620 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Rab11fip1Q9D620 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab11fip1Q9D620 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab11fip1Q9D620 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
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Rab11fip1Q9D620 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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