Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Y1

Ccdc39, Coiled-coil domain-containing protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc39Q9D5Y1 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc39Q9D5Y1 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc39Q9D5Y1 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc39Q9D5Y1 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc39Q9D5Y1 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc39Q9D5Y1 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc39Q9D5Y1 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc39Q9D5Y1 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc39Q9D5Y1 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc39Q9D5Y1 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc39Q9D5Y1 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc39Q9D5Y1 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc39Q9D5Y1 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc39Q9D5Y1 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc39Q9D5Y1 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc39Q9D5Y1 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc39Q9D5Y1 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc39Q9D5Y1 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc39Q9D5Y1 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc39Q9D5Y1 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc39Q9D5Y1 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc39Q9D5Y1 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc39Q9D5Y1 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc39Q9D5Y1 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc39Q9D5Y1 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc39Q9D5Y1 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc39Q9D5Y1 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc39Q9D5Y1 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc39Q9D5Y1 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc39Q9D5Y1 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc39Q9D5Y1 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc39Q9D5Y1 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc39Q9D5Y1 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc39Q9D5Y1 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc39Q9D5Y1 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc39Q9D5Y1 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc39Q9D5Y1 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc39Q9D5Y1 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc39Q9D5Y1 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc39Q9D5Y1 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc39Q9D5Y1 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc39Q9D5Y1 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc39Q9D5Y1 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc39Q9D5Y1 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc39Q9D5Y1 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc39Q9D5Y1 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc39Q9D5Y1 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc39Q9D5Y1 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc39Q9D5Y1 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc39Q9D5Y1 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc39Q9D5Y1 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc39Q9D5Y1 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc39Q9D5Y1 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc39Q9D5Y1 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc39Q9D5Y1 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc39Q9D5Y1 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc39Q9D5Y1 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc39Q9D5Y1 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc39Q9D5Y1 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc39Q9D5Y1 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc39Q9D5Y1 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc39Q9D5Y1 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc39Q9D5Y1 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc39Q9D5Y1 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc39Q9D5Y1 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc39Q9D5Y1 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc39Q9D5Y1 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc39Q9D5Y1 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc39Q9D5Y1 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc39Q9D5Y1 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc39Q9D5Y1 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc39Q9D5Y1 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc39Q9D5Y1 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc39Q9D5Y1 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc39Q9D5Y1 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc39Q9D5Y1 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc39Q9D5Y1 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc39Q9D5Y1 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc39Q9D5Y1 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc39Q9D5Y1 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc39Q9D5Y1 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc39Q9D5Y1 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc39Q9D5Y1 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc39Q9D5Y1 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc39Q9D5Y1 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc39Q9D5Y1 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc39Q9D5Y1 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc39Q9D5Y1 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc39Q9D5Y1 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc39Q9D5Y1 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc39Q9D5Y1 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc39Q9D5Y1 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc39Q9D5Y1 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc39Q9D5Y1 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc39Q9D5Y1 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc39Q9D5Y1 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc39Q9D5Y1 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc39Q9D5Y1 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc39Q9D5Y1 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc39Q9D5Y1 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms