Protein–RNA interactions for Protein: Q9D534

Zc2hc1b, Zinc finger C2HC domain-containing protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc2hc1bQ9D534 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Zc2hc1bQ9D534 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Zc2hc1bQ9D534 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Zc2hc1bQ9D534 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Zc2hc1bQ9D534 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Zc2hc1bQ9D534 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Zc2hc1bQ9D534 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Zc2hc1bQ9D534 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Zc2hc1bQ9D534 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Zc2hc1bQ9D534 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Zc2hc1bQ9D534 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Zc2hc1bQ9D534 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Zc2hc1bQ9D534 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Zc2hc1bQ9D534 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Zc2hc1bQ9D534 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Zc2hc1bQ9D534 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Zc2hc1bQ9D534 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Zc2hc1bQ9D534 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Zc2hc1bQ9D534 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
Zc2hc1bQ9D534 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Zc2hc1bQ9D534 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Zc2hc1bQ9D534 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Zc2hc1bQ9D534 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Zc2hc1bQ9D534 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Zc2hc1bQ9D534 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Zc2hc1bQ9D534 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Zc2hc1bQ9D534 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Zc2hc1bQ9D534 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Zc2hc1bQ9D534 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Zc2hc1bQ9D534 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Zc2hc1bQ9D534 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Zc2hc1bQ9D534 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Zc2hc1bQ9D534 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Zc2hc1bQ9D534 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Zc2hc1bQ9D534 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Zc2hc1bQ9D534 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Zc2hc1bQ9D534 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Zc2hc1bQ9D534 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Zc2hc1bQ9D534 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Zc2hc1bQ9D534 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Zc2hc1bQ9D534 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Zc2hc1bQ9D534 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Zc2hc1bQ9D534 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Zc2hc1bQ9D534 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Zc2hc1bQ9D534 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Zc2hc1bQ9D534 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Zc2hc1bQ9D534 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Zc2hc1bQ9D534 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Zc2hc1bQ9D534 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Zc2hc1bQ9D534 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Zc2hc1bQ9D534 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Zc2hc1bQ9D534 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Zc2hc1bQ9D534 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Zc2hc1bQ9D534 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Zc2hc1bQ9D534 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Zc2hc1bQ9D534 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Zc2hc1bQ9D534 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Zc2hc1bQ9D534 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Zc2hc1bQ9D534 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Zc2hc1bQ9D534 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Zc2hc1bQ9D534 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Zc2hc1bQ9D534 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Zc2hc1bQ9D534 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Zc2hc1bQ9D534 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Zc2hc1bQ9D534 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Zc2hc1bQ9D534 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Zc2hc1bQ9D534 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Zc2hc1bQ9D534 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Zc2hc1bQ9D534 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Zc2hc1bQ9D534 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Zc2hc1bQ9D534 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Zc2hc1bQ9D534 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Zc2hc1bQ9D534 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Zc2hc1bQ9D534 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Zc2hc1bQ9D534 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Zc2hc1bQ9D534 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Zc2hc1bQ9D534 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Zc2hc1bQ9D534 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Zc2hc1bQ9D534 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Zc2hc1bQ9D534 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Zc2hc1bQ9D534 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Zc2hc1bQ9D534 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Zc2hc1bQ9D534 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Zc2hc1bQ9D534 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Zc2hc1bQ9D534 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Zc2hc1bQ9D534 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Zc2hc1bQ9D534 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Zc2hc1bQ9D534 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Zc2hc1bQ9D534 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Zc2hc1bQ9D534 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Zc2hc1bQ9D534 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Zc2hc1bQ9D534 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Zc2hc1bQ9D534 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Zc2hc1bQ9D534 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Zc2hc1bQ9D534 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Zc2hc1bQ9D534 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Zc2hc1bQ9D534 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Zc2hc1bQ9D534 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Zc2hc1bQ9D534 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Zc2hc1bQ9D534 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms