Protein–RNA interactions for Protein: Q9D479

Uvssa, UV-stimulated scaffold protein A, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UvssaQ9D479 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
UvssaQ9D479 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
UvssaQ9D479 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
UvssaQ9D479 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
UvssaQ9D479 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
UvssaQ9D479 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
UvssaQ9D479 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
UvssaQ9D479 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
UvssaQ9D479 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
UvssaQ9D479 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
UvssaQ9D479 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
UvssaQ9D479 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
UvssaQ9D479 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
UvssaQ9D479 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
UvssaQ9D479 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
UvssaQ9D479 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
UvssaQ9D479 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
UvssaQ9D479 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
UvssaQ9D479 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
UvssaQ9D479 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
UvssaQ9D479 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
UvssaQ9D479 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
UvssaQ9D479 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
UvssaQ9D479 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
UvssaQ9D479 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
UvssaQ9D479 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UvssaQ9D479 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
UvssaQ9D479 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UvssaQ9D479 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UvssaQ9D479 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
UvssaQ9D479 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UvssaQ9D479 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
UvssaQ9D479 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UvssaQ9D479 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
UvssaQ9D479 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
UvssaQ9D479 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
UvssaQ9D479 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
UvssaQ9D479 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UvssaQ9D479 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
UvssaQ9D479 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UvssaQ9D479 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
UvssaQ9D479 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UvssaQ9D479 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
UvssaQ9D479 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
UvssaQ9D479 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
UvssaQ9D479 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
UvssaQ9D479 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
UvssaQ9D479 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
UvssaQ9D479 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
UvssaQ9D479 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
UvssaQ9D479 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
UvssaQ9D479 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
UvssaQ9D479 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC19■□□□□ 0.63
UvssaQ9D479 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC19■□□□□ 0.63
UvssaQ9D479 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
UvssaQ9D479 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
UvssaQ9D479 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
UvssaQ9D479 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
UvssaQ9D479 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
UvssaQ9D479 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC19■□□□□ 0.63
UvssaQ9D479 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
UvssaQ9D479 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
UvssaQ9D479 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
UvssaQ9D479 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
UvssaQ9D479 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
UvssaQ9D479 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
UvssaQ9D479 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
UvssaQ9D479 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
UvssaQ9D479 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
UvssaQ9D479 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
UvssaQ9D479 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC19■□□□□ 0.63
UvssaQ9D479 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UvssaQ9D479 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
UvssaQ9D479 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UvssaQ9D479 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UvssaQ9D479 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UvssaQ9D479 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UvssaQ9D479 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UvssaQ9D479 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UvssaQ9D479 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
UvssaQ9D479 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
UvssaQ9D479 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UvssaQ9D479 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
UvssaQ9D479 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UvssaQ9D479 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UvssaQ9D479 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UvssaQ9D479 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UvssaQ9D479 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UvssaQ9D479 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UvssaQ9D479 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UvssaQ9D479 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UvssaQ9D479 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UvssaQ9D479 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UvssaQ9D479 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UvssaQ9D479 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UvssaQ9D479 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
UvssaQ9D479 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UvssaQ9D479 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UvssaQ9D479 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UvssaQ9D479 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms