Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3X3

4933428M09Rik, RIKEN cDNA 4933428M09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933428M09RikQ9D3X3 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4933428M09RikQ9D3X3 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4933428M09RikQ9D3X3 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4933428M09RikQ9D3X3 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
4933428M09RikQ9D3X3 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
4933428M09RikQ9D3X3 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
4933428M09RikQ9D3X3 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4933428M09RikQ9D3X3 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4933428M09RikQ9D3X3 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
4933428M09RikQ9D3X3 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4933428M09RikQ9D3X3 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4933428M09RikQ9D3X3 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
4933428M09RikQ9D3X3 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4933428M09RikQ9D3X3 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4933428M09RikQ9D3X3 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4933428M09RikQ9D3X3 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4933428M09RikQ9D3X3 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4933428M09RikQ9D3X3 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4933428M09RikQ9D3X3 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4933428M09RikQ9D3X3 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4933428M09RikQ9D3X3 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
4933428M09RikQ9D3X3 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4933428M09RikQ9D3X3 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4933428M09RikQ9D3X3 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
4933428M09RikQ9D3X3 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4933428M09RikQ9D3X3 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
4933428M09RikQ9D3X3 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4933428M09RikQ9D3X3 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4933428M09RikQ9D3X3 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4933428M09RikQ9D3X3 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
4933428M09RikQ9D3X3 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4933428M09RikQ9D3X3 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4933428M09RikQ9D3X3 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4933428M09RikQ9D3X3 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
4933428M09RikQ9D3X3 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
4933428M09RikQ9D3X3 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4933428M09RikQ9D3X3 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4933428M09RikQ9D3X3 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4933428M09RikQ9D3X3 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4933428M09RikQ9D3X3 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4933428M09RikQ9D3X3 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
4933428M09RikQ9D3X3 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4933428M09RikQ9D3X3 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4933428M09RikQ9D3X3 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4933428M09RikQ9D3X3 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
4933428M09RikQ9D3X3 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4933428M09RikQ9D3X3 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
4933428M09RikQ9D3X3 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4933428M09RikQ9D3X3 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4933428M09RikQ9D3X3 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4933428M09RikQ9D3X3 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
4933428M09RikQ9D3X3 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
4933428M09RikQ9D3X3 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4933428M09RikQ9D3X3 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4933428M09RikQ9D3X3 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4933428M09RikQ9D3X3 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4933428M09RikQ9D3X3 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4933428M09RikQ9D3X3 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4933428M09RikQ9D3X3 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
4933428M09RikQ9D3X3 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4933428M09RikQ9D3X3 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4933428M09RikQ9D3X3 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
4933428M09RikQ9D3X3 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4933428M09RikQ9D3X3 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4933428M09RikQ9D3X3 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4933428M09RikQ9D3X3 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4933428M09RikQ9D3X3 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4933428M09RikQ9D3X3 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4933428M09RikQ9D3X3 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
4933428M09RikQ9D3X3 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
4933428M09RikQ9D3X3 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
4933428M09RikQ9D3X3 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
4933428M09RikQ9D3X3 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
4933428M09RikQ9D3X3 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
4933428M09RikQ9D3X3 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
4933428M09RikQ9D3X3 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
4933428M09RikQ9D3X3 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4933428M09RikQ9D3X3 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4933428M09RikQ9D3X3 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4933428M09RikQ9D3X3 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
4933428M09RikQ9D3X3 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4933428M09RikQ9D3X3 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4933428M09RikQ9D3X3 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4933428M09RikQ9D3X3 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4933428M09RikQ9D3X3 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
4933428M09RikQ9D3X3 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4933428M09RikQ9D3X3 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4933428M09RikQ9D3X3 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
4933428M09RikQ9D3X3 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
4933428M09RikQ9D3X3 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4933428M09RikQ9D3X3 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4933428M09RikQ9D3X3 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4933428M09RikQ9D3X3 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
4933428M09RikQ9D3X3 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4933428M09RikQ9D3X3 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
4933428M09RikQ9D3X3 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
4933428M09RikQ9D3X3 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4933428M09RikQ9D3X3 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4933428M09RikQ9D3X3 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4933428M09RikQ9D3X3 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms