Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pramef12Q9D2F1 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pramef12Q9D2F1 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pramef12Q9D2F1 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pramef12Q9D2F1 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pramef12Q9D2F1 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pramef12Q9D2F1 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pramef12Q9D2F1 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pramef12Q9D2F1 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pramef12Q9D2F1 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pramef12Q9D2F1 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Pramef12Q9D2F1 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Pramef12Q9D2F1 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pramef12Q9D2F1 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pramef12Q9D2F1 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pramef12Q9D2F1 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pramef12Q9D2F1 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pramef12Q9D2F1 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pramef12Q9D2F1 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pramef12Q9D2F1 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pramef12Q9D2F1 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pramef12Q9D2F1 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Pramef12Q9D2F1 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pramef12Q9D2F1 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pramef12Q9D2F1 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pramef12Q9D2F1 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pramef12Q9D2F1 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pramef12Q9D2F1 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Pramef12Q9D2F1 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pramef12Q9D2F1 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pramef12Q9D2F1 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pramef12Q9D2F1 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pramef12Q9D2F1 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Pramef12Q9D2F1 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pramef12Q9D2F1 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pramef12Q9D2F1 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pramef12Q9D2F1 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pramef12Q9D2F1 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pramef12Q9D2F1 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pramef12Q9D2F1 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pramef12Q9D2F1 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pramef12Q9D2F1 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pramef12Q9D2F1 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Pramef12Q9D2F1 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pramef12Q9D2F1 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pramef12Q9D2F1 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pramef12Q9D2F1 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pramef12Q9D2F1 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pramef12Q9D2F1 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pramef12Q9D2F1 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pramef12Q9D2F1 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Pramef12Q9D2F1 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pramef12Q9D2F1 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pramef12Q9D2F1 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pramef12Q9D2F1 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pramef12Q9D2F1 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pramef12Q9D2F1 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pramef12Q9D2F1 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pramef12Q9D2F1 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pramef12Q9D2F1 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pramef12Q9D2F1 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pramef12Q9D2F1 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pramef12Q9D2F1 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pramef12Q9D2F1 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pramef12Q9D2F1 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Pramef12Q9D2F1 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pramef12Q9D2F1 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pramef12Q9D2F1 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pramef12Q9D2F1 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pramef12Q9D2F1 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Pramef12Q9D2F1 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pramef12Q9D2F1 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pramef12Q9D2F1 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pramef12Q9D2F1 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pramef12Q9D2F1 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pramef12Q9D2F1 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pramef12Q9D2F1 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pramef12Q9D2F1 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pramef12Q9D2F1 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pramef12Q9D2F1 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pramef12Q9D2F1 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pramef12Q9D2F1 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pramef12Q9D2F1 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pramef12Q9D2F1 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pramef12Q9D2F1 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pramef12Q9D2F1 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pramef12Q9D2F1 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pramef12Q9D2F1 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pramef12Q9D2F1 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pramef12Q9D2F1 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pramef12Q9D2F1 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pramef12Q9D2F1 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pramef12Q9D2F1 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Pramef12Q9D2F1 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pramef12Q9D2F1 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pramef12Q9D2F1 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Pramef12Q9D2F1 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pramef12Q9D2F1 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pramef12Q9D2F1 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Pramef12Q9D2F1 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.3 ms