Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1R9

Rpl34, 60S ribosomal protein L34, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl34Q9D1R9 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl34Q9D1R9 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl34Q9D1R9 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl34Q9D1R9 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl34Q9D1R9 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl34Q9D1R9 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl34Q9D1R9 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl34Q9D1R9 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl34Q9D1R9 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl34Q9D1R9 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl34Q9D1R9 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl34Q9D1R9 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl34Q9D1R9 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl34Q9D1R9 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl34Q9D1R9 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl34Q9D1R9 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl34Q9D1R9 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl34Q9D1R9 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl34Q9D1R9 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl34Q9D1R9 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl34Q9D1R9 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl34Q9D1R9 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl34Q9D1R9 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl34Q9D1R9 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl34Q9D1R9 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl34Q9D1R9 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl34Q9D1R9 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl34Q9D1R9 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl34Q9D1R9 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl34Q9D1R9 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl34Q9D1R9 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl34Q9D1R9 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl34Q9D1R9 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl34Q9D1R9 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl34Q9D1R9 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl34Q9D1R9 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl34Q9D1R9 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl34Q9D1R9 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl34Q9D1R9 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl34Q9D1R9 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl34Q9D1R9 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl34Q9D1R9 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl34Q9D1R9 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl34Q9D1R9 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl34Q9D1R9 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl34Q9D1R9 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl34Q9D1R9 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl34Q9D1R9 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl34Q9D1R9 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl34Q9D1R9 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl34Q9D1R9 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl34Q9D1R9 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl34Q9D1R9 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl34Q9D1R9 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl34Q9D1R9 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl34Q9D1R9 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl34Q9D1R9 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl34Q9D1R9 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl34Q9D1R9 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl34Q9D1R9 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl34Q9D1R9 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl34Q9D1R9 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl34Q9D1R9 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl34Q9D1R9 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rpl34Q9D1R9 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rpl34Q9D1R9 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rpl34Q9D1R9 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rpl34Q9D1R9 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rpl34Q9D1R9 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rpl34Q9D1R9 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rpl34Q9D1R9 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rpl34Q9D1R9 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rpl34Q9D1R9 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rpl34Q9D1R9 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rpl34Q9D1R9 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rpl34Q9D1R9 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl34Q9D1R9 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl34Q9D1R9 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl34Q9D1R9 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl34Q9D1R9 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl34Q9D1R9 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl34Q9D1R9 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl34Q9D1R9 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl34Q9D1R9 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl34Q9D1R9 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl34Q9D1R9 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl34Q9D1R9 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl34Q9D1R9 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl34Q9D1R9 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl34Q9D1R9 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl34Q9D1R9 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl34Q9D1R9 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl34Q9D1R9 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl34Q9D1R9 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl34Q9D1R9 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl34Q9D1R9 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl34Q9D1R9 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl34Q9D1R9 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl34Q9D1R9 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl34Q9D1R9 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms