Protein–RNA interactions for Protein: Q9D176

Susd3, Sushi domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd3Q9D176 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Susd3Q9D176 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Susd3Q9D176 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Susd3Q9D176 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Susd3Q9D176 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Susd3Q9D176 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Susd3Q9D176 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Susd3Q9D176 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Susd3Q9D176 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Susd3Q9D176 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Susd3Q9D176 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Susd3Q9D176 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Susd3Q9D176 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Susd3Q9D176 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Susd3Q9D176 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Susd3Q9D176 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Susd3Q9D176 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Susd3Q9D176 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Susd3Q9D176 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Susd3Q9D176 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Susd3Q9D176 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Susd3Q9D176 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Susd3Q9D176 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Susd3Q9D176 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Susd3Q9D176 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Susd3Q9D176 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Susd3Q9D176 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Susd3Q9D176 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Susd3Q9D176 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Susd3Q9D176 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Susd3Q9D176 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Susd3Q9D176 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Susd3Q9D176 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Susd3Q9D176 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Susd3Q9D176 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Susd3Q9D176 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Susd3Q9D176 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Susd3Q9D176 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Susd3Q9D176 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Susd3Q9D176 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Susd3Q9D176 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Susd3Q9D176 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Susd3Q9D176 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Susd3Q9D176 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Susd3Q9D176 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Susd3Q9D176 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Susd3Q9D176 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Susd3Q9D176 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Susd3Q9D176 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Susd3Q9D176 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Susd3Q9D176 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Susd3Q9D176 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Susd3Q9D176 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Susd3Q9D176 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Susd3Q9D176 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Susd3Q9D176 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Susd3Q9D176 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Susd3Q9D176 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Susd3Q9D176 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Susd3Q9D176 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Susd3Q9D176 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Susd3Q9D176 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Susd3Q9D176 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Susd3Q9D176 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Susd3Q9D176 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Susd3Q9D176 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Susd3Q9D176 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Susd3Q9D176 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Susd3Q9D176 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Susd3Q9D176 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Susd3Q9D176 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Susd3Q9D176 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Susd3Q9D176 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Susd3Q9D176 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Susd3Q9D176 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Susd3Q9D176 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Susd3Q9D176 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Susd3Q9D176 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Susd3Q9D176 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Susd3Q9D176 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Susd3Q9D176 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Susd3Q9D176 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Susd3Q9D176 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Susd3Q9D176 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Susd3Q9D176 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Susd3Q9D176 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Susd3Q9D176 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Susd3Q9D176 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Susd3Q9D176 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Susd3Q9D176 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Susd3Q9D176 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Susd3Q9D176 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Susd3Q9D176 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Susd3Q9D176 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Susd3Q9D176 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Susd3Q9D176 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Susd3Q9D176 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Susd3Q9D176 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Susd3Q9D176 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Susd3Q9D176 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms