Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0Z3

Tmem53, Transmembrane protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem53Q9D0Z3 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem53Q9D0Z3 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem53Q9D0Z3 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem53Q9D0Z3 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem53Q9D0Z3 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem53Q9D0Z3 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem53Q9D0Z3 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem53Q9D0Z3 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tmem53Q9D0Z3 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem53Q9D0Z3 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem53Q9D0Z3 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem53Q9D0Z3 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem53Q9D0Z3 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem53Q9D0Z3 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem53Q9D0Z3 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem53Q9D0Z3 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem53Q9D0Z3 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem53Q9D0Z3 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem53Q9D0Z3 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem53Q9D0Z3 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem53Q9D0Z3 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem53Q9D0Z3 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem53Q9D0Z3 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem53Q9D0Z3 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem53Q9D0Z3 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms