Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zbed3Q9D0L1 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zbed3Q9D0L1 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zbed3Q9D0L1 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zbed3Q9D0L1 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zbed3Q9D0L1 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zbed3Q9D0L1 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zbed3Q9D0L1 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zbed3Q9D0L1 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Zbed3Q9D0L1 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Zbed3Q9D0L1 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Zbed3Q9D0L1 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Zbed3Q9D0L1 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Zbed3Q9D0L1 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Zbed3Q9D0L1 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zbed3Q9D0L1 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zbed3Q9D0L1 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zbed3Q9D0L1 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zbed3Q9D0L1 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zbed3Q9D0L1 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zbed3Q9D0L1 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zbed3Q9D0L1 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zbed3Q9D0L1 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Zbed3Q9D0L1 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zbed3Q9D0L1 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zbed3Q9D0L1 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Zbed3Q9D0L1 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Zbed3Q9D0L1 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zbed3Q9D0L1 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Zbed3Q9D0L1 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zbed3Q9D0L1 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zbed3Q9D0L1 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zbed3Q9D0L1 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zbed3Q9D0L1 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zbed3Q9D0L1 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zbed3Q9D0L1 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zbed3Q9D0L1 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zbed3Q9D0L1 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zbed3Q9D0L1 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Zbed3Q9D0L1 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Zbed3Q9D0L1 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Zbed3Q9D0L1 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Zbed3Q9D0L1 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zbed3Q9D0L1 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Zbed3Q9D0L1 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Zbed3Q9D0L1 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zbed3Q9D0L1 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zbed3Q9D0L1 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Zbed3Q9D0L1 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Zbed3Q9D0L1 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zbed3Q9D0L1 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zbed3Q9D0L1 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zbed3Q9D0L1 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zbed3Q9D0L1 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Zbed3Q9D0L1 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zbed3Q9D0L1 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zbed3Q9D0L1 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zbed3Q9D0L1 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Zbed3Q9D0L1 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zbed3Q9D0L1 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zbed3Q9D0L1 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zbed3Q9D0L1 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zbed3Q9D0L1 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zbed3Q9D0L1 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zbed3Q9D0L1 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zbed3Q9D0L1 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zbed3Q9D0L1 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zbed3Q9D0L1 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
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Zbed3Q9D0L1 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zbed3Q9D0L1 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zbed3Q9D0L1 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zbed3Q9D0L1 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zbed3Q9D0L1 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zbed3Q9D0L1 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zbed3Q9D0L1 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zbed3Q9D0L1 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zbed3Q9D0L1 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zbed3Q9D0L1 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zbed3Q9D0L1 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zbed3Q9D0L1 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zbed3Q9D0L1 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zbed3Q9D0L1 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zbed3Q9D0L1 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zbed3Q9D0L1 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Zbed3Q9D0L1 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Zbed3Q9D0L1 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Zbed3Q9D0L1 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zbed3Q9D0L1 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zbed3Q9D0L1 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zbed3Q9D0L1 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zbed3Q9D0L1 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zbed3Q9D0L1 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zbed3Q9D0L1 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zbed3Q9D0L1 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Zbed3Q9D0L1 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Zbed3Q9D0L1 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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